安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题答疑
随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。
Nat Biotechnol:中外科学家联手开发出MEMOTE工具,可用于改善对全基因组范围代谢模型的质量控制
2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---全基因组范围代谢模型(genome-scale metabolic model, GEM)的应用领域非常广泛,从设计细胞工厂和研究癌症代谢到分析微生物如何在我们的肠道内相互作用。因此,手动和自动生成的全基因组范围代谢模型的出版物数量每年都在增长。这可以被看作是一件积极的事情,但是很多数据对于其他人来说很难在不同的
我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序
北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目前,RNA测序技
安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题
随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。
关于癌症全基因组 我们有了全新的认识
今日,最新一期《自然》杂志如约上线,而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题:在本期《自然》杂志上,一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列论文发表。那么,是什么样的研究项目引起了如此的重视呢?具体来看,主导这些研究的是“泛癌症全
国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列
国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。
中国古代家犬线粒体全基因组研究获进展
2020年1月8日,《分子生物学与进化》(Molecular Biology and Evolution)在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室研究员付巧妹团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古代家犬线粒体全基因组的研究成果。研究结果表明,所获得的26例
Science:对人类血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
2019年12月31日讯/生物谷BIOON/---在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。以前,人类蛋白质
Nature:有史以来对人类转移性实体瘤的最大规模全基因组研究
2019年12月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自荷兰和澳大利亚的多个研究机构的研究人员对转移性实体瘤开展了有史以来最大规模的全基因组研究。相关研究结果近期发表在Nature期刊上。
安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念
实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。本次讲座将覆