Nature 子刊：超1.8万人全基因组关联分析，揭示遗传因素如何影响我们的肠道菌群？
肠道微生物菌群是贯穿人类整个生命周期中最丰富的微生物组成部分。近年来的许多研究发现，肠道微生物与人体许多功能的正常运转密切相关，不仅可以帮助我们消化食物，训练免疫系统，还能通过脑肠轴影响大脑情绪。通常认为，饮食和药物等环境因素在塑造肠道微生物组成中起着重要作用，但仍存在个体之间的肠道微生物组成差异超过80%的现象无法解释，这意味着或许
Nature：全基因组加倍赋予肿瘤细胞独特的遗传弱点
2021年2月1日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国波士顿大学医学院的研究人员鉴定出对发生全基因组加倍（whole genome doubling, WGD）的肿瘤细胞的生存能力至关重要但是对构成人类组织大部分的正常细胞来说却不是必需的蛋白。相关研究结果于2021年1月27日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Whole-genom
全基因组测序揭示番石榴维生素C合成和果实软化遗传基础
番石榴（Psidium guajava）是桃金娘科的重要果树，主要产于美洲和亚洲热带及亚热带地区。它因适应性强、容易栽培，产量高，且富含维生素C（抗坏血酸）等营养物质而广受欢迎，被誉为“热带苹果”。番石榴果实是重要的天然维生素C来源，但其维生素C合成的遗传基础却少有研究。桃金娘科是植物果实类型演化研究的重要模式，兼有肉质的
科研人员完成染色体水平青虾全基因组图谱拼装
日前，中国水产科学研究院淡水渔业研究中心傅洪拓研究员团队与华大海洋研究院石琼研究员团队合作，完成了染色体水平青虾基因组图谱拼装，该项工作是青虾和虾蟹类基因组研究的重要突破。研究团队依托江苏省水产三新工程“基于全基因组测序的青虾种质资源和功能基因挖掘（D2015-16）”等项目的资助，对青虾进行全基因组测序和拼装。由于青虾基因组约为4.
从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构
美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法，可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示，单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而，将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果产业健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构，正式启动草果全基
Mol Cell：整合子或能作为人类转录组的“守护者”
2021年1月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自奥胡斯大学等机构的科学家们通过研究揭示了一种特殊的细胞特性，其或能保护机体细胞免于基因表达的有毒副产物的影响。这种活性对于多细胞有机体维持一个强大的基因产物进化“库”的能力而言非常重要。制造过程需要质量控制系统来确保功能性产品的适当组装，
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法，并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）可解决基因组重复区域的组装难题，提高基因组完整性，已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中，纳米孔（Nanopore）测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低，并且由于其可实现超长读长（高达1Mbp），在复杂基因组组装中具有天然优势。然
Science子刊：我国科学家基于全基因组筛选鉴定出促进细胞衰老的基因KAT7
2021年1月8日讯/生物谷BIOON/---理解细胞衰老的遗传学和表观遗传学基础对于开发减缓衰老的干预措施至关重要。虽然已知细胞衰老会促进老化，但控制这一过程的许多机制仍然知之甚少。在一项新的研究中，来自中国科学院、中国科学院大学、北京大学和首都医科大学宣武医院的研究人员使用两种类型的表现出加速衰老的人间充质前体细胞（hMPC）进行了基于CRISPR-Ca
利用纳米孔测序研究人体组织样本等位基因效应对转录组结构的影响
不同的组织和个体之间的基因表达和调控的差异很大，大部分的常见复杂性状相关的基因组通过假定表达和剪接机制来发挥作用，如10%的致病突变都具有已知的剪接效应，RNA测序则能够很好的分析等位基因特异性并解读遗传变异。迄今为止的大多数RNA测序研究都使用短读长RNA测序技术；由于短读长容易出现多重定位的情况，因此很难确定异构体的来源，同时会给定量带来干扰