蛋白质聚合物,爬行细胞和“彗星尾巴”
在第1部分,塞里奥特博士解释了小, 纳米尺寸的肌动蛋白分子可以自组装成细丝,都是几百微米的长度。这些肌动蛋白丝是不断增长和萎缩而这种动态行为允许网络的肌动蛋白产生足够的力量向前移动细胞。细胞内的细菌病原体单核细胞增生李斯特氏菌利用肌动蛋白聚合推动自身通过细胞质和侵入其他细胞。多年的研究使用单允许研究和其他解剖调节肌动蛋白网络的增长在单“彗星尾巴”和爬行细胞的前缘。
蛋白折叠的传染病和癌症中的蛋白质折叠
第1A,Lindquist博士解释了蛋白质的折叠问题。蛋白质离开核糖体是长的,氨基酸的线性链但他们需要折叠成复杂的三维形状在非常细胞质的拥挤环境。由于蛋白质错误折叠可以是灾难性的细胞,蛋白质被称为热休克蛋白(HSP)已经发展到促进适当的蛋白质折叠。Lindquist解释说,有时候热休克反应变得不平衡导致人类疾病。在癌症的情况下,热休克蛋白帮助癌细胞生存的压力通常会杀死他们。相反,许多神经退行性疾病,是由于蛋白质错误折叠和聚集表明,在这些疾病,热休克蛋白应没有活性。酵母有许多与人类相同的细胞过程包括对蛋白质折叠和防止蛋白质聚集。部分1b,Lindquist描述如何在酵母中的基因筛选帮助科学家确定突变这增加了形成类似于那些发现的聚集体在神经退行性疾病。另外一个屏幕在酵母中的500000种化学物质确定了一些化合物防止蛋白质聚集。从这两个实验的结果已被验证在小鼠和人类神经元模型。
邓富刚:精准医学蛋白质研究技术
介绍了一些精准医学蛋白质研究的看法:样本的精准(肿瘤干细胞、特定区域细胞/特定功能细胞);精准到单细胞蛋白表达分析(肿瘤细胞、干细胞异质性)提到蛋白质Isoforms;蛋白质PTM结果解读方式的改变。介绍了一些PTM isoforms pattern 文章,提到靶向治疗信号通路研究。Single-cell western 。肿瘤细胞异质性。单细胞蛋白磷酸化水平差异。
蛋白质组学在生命科学研究中的应用
本课程从宏观角度阐述蛋白组学技术在科研领域中如何更好的帮助科研人员解决问题,怎么做一个好科研,如何快速精准获得有创意的科研思路,蛋白组学技术有哪些,原理及流程,蛋白组学技术在各领域研究中的应用。 沈博还会与您分享如此高效高产的方法,如番茄工作法、时间管理、思维导图、Omnifocus、Calendar和印象笔记等在他科研和生活中的运用。
修饰蛋白质组学研究思路及SCI文章解析
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特意分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。 蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生相应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。 本次课程中科新生命王文婕博士就“修饰蛋白质组学的研究思路及SCI文章解析”为题展开讨论,向大家介绍修饰蛋白质组学的技术方法及研究进展,以及在SCI文章中的实验设计思路。
詹显全:硝基化蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用
介绍了讨论蛋白质硝基化与肿瘤的关系,硝基化蛋白质组学的策略、特点及其在肿瘤研究中的应用,肿瘤硝基化蛋白质组学的现状及未来发展趋势。
农林领域快速发表文献的蹊径--蛋白质后修饰表达谱
蛋白质后修饰(Protein Post-translational Modification, PTM)是蛋白质行使功能的最高级形态,也是信号通路调控、表观遗传的核心内容。同时,作为农林领域研究的战略前沿,蛋白质后修饰的相关研究也是快速发表SCI文章的蹊径。今天我们讲座的内容主要针对最简单、最快速、经费最低的功能蛋白质修饰表达谱解析(定性研究)作为切入点,系统讲解对某一物种、某一领域进行蛋白质后修饰做开创性、奠基性修饰研究的原理、流程及SCI案例分享。
蛋白质氨基酸修饰的发现和生理意义研究
氨基酸是细胞信号和代谢的重要调控因子。氨酰tRNA合成酶(ARS)和它所对应的氨基酸通常有着类似的调控功能。我们发现每个ARS可以催化形成相应的蛋白质赖氨酸上的氨基酸修饰并且传递氨基酸的信号。在细胞里,氨基酸可以促进ARS和它的底物蛋白的相互作用,从而促使ARS将活化的氨酰-腺苷酸(氨酰-AMP)结合到底物蛋白的赖氨酸的侧链氨基上形成氨基酸修饰。氨基酸修饰可以被去乙酰化酶SIRT家族去修饰,特别是SIRT1和SIRT3。说明了去氨基酸修饰和去乙酰化修饰可能有着类似的机理。mTORC1 信号通路中的关键蛋白RagA/B 的142位赖氨酸(K142)上的可逆的亮氨酸修饰可以调控mTORC1信号通路的活性。细胞凋亡信号通路中的关键蛋白caspase9的 409/410位赖氨酸(K409/410)以及 ASK1 的688位赖氨酸(K688)上的谷氨酰胺修饰可以抑制细胞的凋亡。总的来说,我们发现了ARS的不同于蛋白质合成的新的催化活性,以及细胞内氨基酸信号的感知和传递的机制,并为氨基酸和ARS的调控功能提供了新的机理解释。 关于【第一作者讲坛】: CST十分重视为科学家的成就喝彩,为科学家的成长赋能。自2008年进入中国起,就和中国细胞生物学学会、中国细胞生物学学报等合作,先后冠名或设立终身成就奖、杰出成就奖、优秀青年研究员奖、优秀论文奖、CST卓越创新转化奖、细胞生物学科学研究优秀人才奖/科研新秀奖,第九届厦门学术会议-CST最佳墙报奖等。 近几年,随着中国科研水平的提升,很多包括80后,90后在内的青年学者已经在国际学术舞台上崭露头角。为了给青年学者提供更自由开放的展示学术成果的机会,促进科研工作者更有效的学术交流,CST在生物谷行云学院开创“第一作者讲坛”。“第一作者讲坛”将邀请已发表有影响力的同行评阅论文的国内外青年才俊,讲述自己的科研故事,促进科研思路的交流,创新技术的探讨。“第一作者讲坛”希望通过“第一作者”的亲历自述,启发更多科研工作者的创新发现。