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研究以基因组中心解析北美白垩纪晚期尖角龙化石中的新型微生物谱系

  古生物学研究曾频繁报道,中生代恐龙化石经过约2.5亿年~6500万年仍然出乎意料地保存着胶原蛋白、血管等内源性有机物。但考虑到蛋白质易于降解,且在逾百万年的时间里微生物很多已聚居于骨骼中的孔隙内,所以这些内源性的软组织是否可以残存在中生代化石骨骼中一直备受争议。研究人员对蛋白质不稳定性进行了广泛研究,但恐龙化石骨骼中微生物群的基因组多

2020-05-16

科学家在9天内成功对11个人类基因组进行完整测序

2020年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --三年前,来自加利福尼亚大学圣克鲁兹分校的科学家们就通过研究证明,利用在校园开发的相同纳米孔测序就能实现对对人类基因组的长时间阅读分析,这在当时的确是一项巨大的研究进展,但其却需要15万小时的计算时间和数周的工作。一年后,研究者开发的名为PromethION的纳米孔测序仪就被证明是非常快速、且便宜而且容易操作的

2020-05-07

基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

中国南方喀斯特起源古老、分布广泛。该地区气候温和、水分充足,广泛分布的峰林、峰丛、溶洞、天坑等复杂的地貌形态形成独特的岛屿化生境,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。经过漫长的演化,华南喀斯特地区孕育了高度的物种多样性和特有性。喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进化的理解还非常缺乏。全基因组复制(

2020-04-17

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题答疑

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

2020-03-11

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

2020-02-21

国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

2020-01-30

安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念

实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。本次讲座将覆

2019-11-25

安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念

实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。本次讲座将覆

2019-11-18

研究发现藏族人群三代测序高质量参考基因组并解析全基因组结构变异

 10月23日,《国家科学评论》杂志在线发布了第一个藏族人群高质量参考基因组。该成果是中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组、西藏大学欧珠罗布与崔超英课题组、中国科学院上海营养与健康研究所徐书华课题组、青海省高原医学科学研究院吴天一课题组等,经过两年多联合攻关完成的藏族人群高原适应研究的又一阶段性成果,旨在利用长片段基因组数据从头组装藏族人群的高质量参考基因组,以期解析藏族人群基因组中的大片

2019-10-30

PNAS:全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染情况

2019年11月1日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,发表在《PNAS》杂志上的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早期发现和遏制未来流行病的步骤。由哥伦比亚大学领导的这项研

2019-11-01