人工智能系统DeepDR精准识别糖尿病视网膜病变
近日，上海交通大学附属第六人民医院内分泌代谢科、上海市糖尿病研究所、上海市糖尿病临床医学中心贾伟平教授课题组题为“A Deep Learning System for Detecting Diabetic Retinopathy Across the Disease Spectrum”（https：//doi.org/10.1038/
Molecular Cell:研究揭示BRCA1-BARD1复合物识别DNA损伤位点的结构与分子基础
DNA双链断裂（DNA double-strand breaks，DSBs）是真核细胞中最严重的DNA损伤类型之一，单个裸露的DSB即可诱发细胞凋亡。DSB主要通过非同源末端连接（NHEJ，non-homologous end-joining）和同源重组（HR，homologous recombination）两种方式进行修复。HR修复发生在S和G2期，受损
Nature子刊：通过机器学习模型识别复杂疾病的重要生物标记物
2021年5月27日讯/随着高通量技术的发展，通过世界各地研究人员的共同努力，形成了大型公共数据库，如癌症基因组图谱（TCGA）。这对阐明疾病表型的分子机制具有重大意义。然而，由于癌症等复杂疾病的病理以及其在遗传、基因组和蛋白质组水平上复杂的分子机制，研究复杂的人类疾病仍具有挑战性。目前，已有很多基于机器学习的方法开发出来，包括非线性核支持向量机（SVMs）
NAR：新程序或能从700多种不同类型的癌细胞出识别出数千种癌症“弱点”
2021年5月28日 讯 /生物谷BIOON/ --当一个基因的状态暴露了细胞对第二个基因扰动的脆弱性时，比如化学抑制作用，此时就会出现薄弱环节，而该环节恰恰就成为了精准肿瘤学研究的切入点，从而就能帮助开发治疗多种癌症的新型疗法。日前，一篇刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上题为“SynLeGG： analysis and visua
Nature Communications：研究揭示固有免疫受体AIM2识别有机污染物，触发炎症反应和组织损伤的新机制
全氟烷基化合物 (Perfluoroalkyl substances， PFAS) 具有良好的疏水疏油性和化学稳定性，被广泛应用于清洁剂、耐水涂料和食品包装等工业和民用领域。然而，PFAS在环境中难以被降解，导致其广泛存在于自然环境介质（如水土和空气）和动植物体内。人体可通过摄取饮用水和食物、吸入空气和粉尘等多种途径接触PFAS。已有大量流行病学研究表明，体
Nat Commun：科学家识别出一种有望修复人类受损心脏的新方法
2021年5月26日 讯 /生物谷BIOON/ --心力衰竭（heart failure）是工业化世界人群发病和死亡的主要原因之一，其主要特点是心脏收缩力受损即心脏输出量降低；在细胞水平下，有多个因素与心力衰竭的发生直接相关；包括钙处理的缺陷、神经激素的失衡和肌原纤维节的功能衰退等，肌原纤维节是心肌收缩的基本分子单元。肌丝（myofilament）作用力产生
通过步态识别个体抑郁症的研究取得进展
抑郁症是一种较为普遍的精神疾病。虽然针对抑郁患者有多种治疗手段（如药物治疗、心理疗法等），但只有不到一半的患者接受了正确治疗。抑郁症诊断困难是其中的重要原因。具体来说，在抑郁初筛的过程中，初级保健医生常常无法有效识别有抑郁症状的患者。此外，基于量表的抑郁诊断方法可能有误诊风险。因此，研究更有效的识别抑郁的方法具有重要意义。姿态症状已被证明是抑郁症的基本表现。
Nature 子刊：多组学数据与机器学习识别新的癌症基因
癌症基因的鉴定在精准肿瘤学和癌症治疗学的发展中起着至关重要的作用。癌症的进展被认为是由驱动基因突变的积累引起的，这些突变赋予细胞选择性的生长优势。在过去的几年里，人们致力于从遗传大数据中找出癌症基因，预测癌症基因的最初方法是寻找显着突变的基因，然而，目前已知的癌症基因（KCG）目录的完整性仍存在争议。尽管成千上万的癌症基因组序列有助于癌症基因的鉴定，但仍存在
PNAS：免疫细胞如何识别并破坏真菌菌丝
天然免疫（innate immunity）为宿主免受真菌感染提供了必不可少的保护。 但是，免疫细胞和真菌病原体之间的相互作用具有复杂的结果，原因在于某些病原体发展出逃避免疫细胞识别，吞噬和杀死的机制。 例如，白色念珠菌可以通过形态变化，形成难以吞噬的长菌丝来逃避吞噬作用。在最近一项研究中，来自英国Foresterhill 医学科学研究所的Alistair J
我国科学家揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装的分子机制
为了应对复杂的生长发育过程，以人类为代表的高等生物进化出了复杂的基因表达调控机制。转录是基因表达的第一步，是基因表达调控的主要阶段。转录起始过程发生在基因转录起始位点上游的启动子区，围绕启动子区转录起始过程的调控，是细胞体系内最为核心的生命过程之一，对其进行研究一直是生命科学的重大前沿课题。复旦大学研究团队利用