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研究构建出长牡蛎染色体水平基因组和变异图谱

   近日,中国科学院海洋所张国范研究组完成的论文Construction of a chromosome-level genome and variation map for the Pacific oyster Crassostrea gigas(《长牡蛎染色体水平基因组和变异图谱构建》),在线发表在Molecular Ec

2021-04-07

研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱

   中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph

2021-05-19

科研人员完成染色体水平青虾全基因组图谱拼装

  日前,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心傅洪拓研究员团队与华大海洋研究院石琼研究员团队合作,完成了染色体水平青虾基因组图谱拼装,该项工作是青虾和虾蟹类基因组研究的重要突破。研究团队依托江苏省水产三新工程“基于全基因组测序的青虾种质资源和功能基因挖掘(D2015-16)”等项目的资助,对青虾进行全基因组测序和拼装。由于青虾基因组约为4.

2021-01-26

研究开发出新型染色体原位多基因表达调控技术

  对复杂的细胞代谢进行重编程需要对多个基因同时进行表达调控。目前常用的基因表达调控方法是在离位(ex-situ)构建启动子或核糖体结合位点(RBS)的质粒文库,转化进入细胞进行筛选,然而该方法受限于克隆效率和转化效率,难以实现多基因同时的表达调控。MAGE技术可在染色体原位(in-situ)产生遗传多样性,从而同时调节多个基因的表达。但

2021-02-07

研究开发出新型染色体原位多基因表达调控技术

  对复杂的细胞代谢进行重编程需要对多个基因同时进行表达调控。目前常用的基因表达调控方法是在离位(ex-situ)构建启动子或核糖体结合位点(RBS)的质粒文库,转化进入细胞进行筛选,然而该方法受限于克隆效率和转化效率,难以实现多基因同时的表达调控。MAGE技术可在染色体原位(in-situ)产生遗传多样性,从而同时调节多个基因的表达。但

2021-02-05

研究揭示同源转座子维持普通小麦多倍基因组高级结构稳定性

  Genome Biology在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧研究组与河南农业大学、中国农业科学院和河南科技学院合作完成的题为Homology-mediated inter-chromosomal interactions in hexaploid wheat lead to specific subgenome ter

2021-01-14

科研人员发表高质量染色体级醋栗番茄基因组序列

醋栗番茄是栽培番茄的野生祖先种,以其优异的抗性、浓郁的风味、可与栽培番茄直接杂交、快速转育优良性状等特点,广泛用作现代番茄育种的重要种质资源。其基因组和遗传多样性的研究,对充分挖掘该野生种质资源的育种潜力和价值,促进番茄产业发展意义重大。因此,醋栗番茄的基因组研究受到研究者关注,此前已有个别基因组草图发布,但是,这些草图并不完整,高度碎片化,限制了它们在育种

2020-12-02

中国水产科学研究院珠江所叶星研究员团队发布首个大口黑鲈染色体水平基因组图谱

 近日,珠江水产研究所叶星研究员团队完成了大口黑鲈染色体水平基因组精细图谱的绘制和遗传解析,研究论文“Chromosome-level genome assembly for the largemouth bassMicropterus salmoidesprovides insights into adaptation to fresh and

2020-11-11

首个染色体水平大蒜基因组图谱绘制成功

7月27日,《分子植物》(Molecular Plant)在线发表首个染色体水平大蒜基因组图谱。被测序的大蒜品种是二水早紫皮蒜,其适用性广,在我国种植地域最广。这项成果由中国农业科学院麻类研究所(以下简称麻类所)南方蛋白饲料植物资源开发与利用团队联合有关高校和企业,历时4年完成。论文通讯作者、麻类所研究员刘头明介绍,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我国大蒜的年播种

2020-08-04

研究揭示脊椎动物异源多倍基因组演化的动态历史

 多倍化现象在脊椎动物中极为罕见;多倍体脊椎动物在多倍化发生和其后的二倍化进程中可能经历基因组休克效应。但对于相关演化遗传机制是什么、机制是否相同等问题,存在不同假说和许多尚待澄清的问题(PNAS 2016及其他文献)。在张亚平院士领导下,云南大学省部共建云南省生物资源保护与利用国家重点实验室罗静教授、中科院昆明动物研究所吕雪梅研究员、湖南师范大学

2020-06-24