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Cell:康奈尔大学郭春君团队成功开发针对非模式肠道细菌基因编辑工具

多组学的研究表明很多肠道微生物的基因与宿主生理功能密切相关,但是由于这些基因大多源于非模式的肠道细菌,例如厚壁菌门梭菌纲,因此揭示这些基因影响宿主的机制目前是一项挑战。与我们所熟知的具有成熟基因编辑方法的模式肠道细菌 (例如大肠杆菌和多形拟杆菌) 不同,这些非模式肠道细菌大多未进行基因组测序,向其中引入含有基因编辑模块的外源DNA的方法以及采用何种合适的基因

2022-01-22

Science:揭示细菌利用可交换的防御基因对抗噬菌体攻击

在一项新的研究中,奥地利维也纳大学微生物学家Martin Polz领导的一个研究团队如今研究了细菌如何抵御病毒捕食者,即噬菌体。该研究表明,细菌具有专门为防御噬菌体而设计的可交换的遗传因子,使细菌群体能够令人惊讶地迅速转换其先天免疫力。

2021-10-25

JAHA:特殊基因或会影响机体血液中有害细菌毒素—脂多糖的水平!

来自芬兰赫尔辛基大学等机构的科学家们通过研究在机体血液中发现了一种与脂多糖水平升高相关的遗传标志物。

2021-10-28

科研人员开发细菌基因组规模预测IV型分泌系统效应蛋白的新软件

近日,上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室在生物信息学顶级刊物《Briefings in Bioinformatics》(IF:11.622)上发表题为“T4SEfinder: a bioinformatics tool for genome-scale prediction of bacterial type IV secreted eff

2021-10-22

Science:研究人员发明平行和连续荧光原位杂交法 可测量单个细菌基因表达情况

加州理工学院研究人员在《科学》杂志上发表研究,介绍其发明的新型平行和连续荧光原位杂交(par-seqFISH)技术,可用于研究细菌种群内的单个细菌基因表达情况,有望成为细胞生物学研究的有力工具。研究人员主要通过基因表达了解细菌动向,而测量基因表达的传统方法通常是把复杂立体的整个细菌种群缩小,导致单个细菌“身份信息”丢失。因此,在微生物研究中,往往观察不到微观

2021-09-05

Nature Communications:利用工程细菌编辑功能性半互穿网络聚合物研究中取得进展

  中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所副研究员戴卓君和美国杜克大学教授游凌冲等,提出了一种全新的可模块化、多样化融合蛋白组分的活体semi-IPN的构建思路,通过微凝胶包裹植入基因线路的两种大肠杆菌。相关研究成果以Living fabrication of functional semi-interpenetrating pol

2021-08-13

新研究发现:口腔细菌或能激活致癌基因

  细菌与癌症的关系一直都十分微妙,1990年科学家首次发现了幽门螺旋杆菌在胃癌中的致病性,证明了细菌可能具有阻止癌细胞“自杀”的能力。去年5月,一篇关于恶性肿瘤内部细菌的研究登上了世界顶级学术期刊《Science》杂志的封面,更是加深了学术界对细菌可能是癌症的“帮凶”这一说法的怀疑。人体作为一座生理之岛,寄存着数以万亿计的细菌和其他微生

2021-06-04

Science:重写细菌基因组遗传密码的新方法可一次在蛋白中添加多种非天然的氨基酸

2021年6月18日讯/生物谷BIOON/---几乎所有的有机体都是通过20种不同的氨基酸组合在一起来构建它们的蛋白质。为了在这种组合过程中添加新的氨基酸,科学家们重新设计了基因和其他的蛋白质构建工具,从而产生了具有独特化学特性的对制造药物很有帮助的蛋白质。但是,这类研究工作很费时费力,而且通常一次只能添加一种新的氨基酸。如今,研究人员打开了做更多事情的闸门

2021-06-18

研究人员利用基因编辑技术成功提高水稻细菌性条斑病的抗性

近日,Plant Biotechnology Journal在线发表了上海交通大学农业与生物学院陈功友课题组题为“Increasing resistance to bacterial leaf streak in rice by editing the promoter of susceptibility gene OsSULRT3;6”的研究简报。该研究利

2021-05-09

开发出microSPLiT技术高通量分析细菌细胞基因表达

2021年2月21日讯/生物谷BIOON/---细菌异质地激活基因表达程序,以应对环境变化、压力和其他刺激。这种行为可能作为一种两头下注策略(bet-hedging strategy),对种群的生长和生存至关重要。由于两头下注程序通常只在一小部分细胞中被激活,对它们的无偏见发现和描述仍然具有挑战性。高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)已经广泛地用于分

2021-02-21