Science：开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq
2019年4月20日讯/生物谷BIOON/---自从CRISPR基因组编辑技术于2012年发明以来，它已经显示出治疗许多难治性疾病的巨大希望。然而，科学家们一直在努力在治疗相关的细胞类型中鉴定潜在的脱靶效应，这仍然是将治疗方法转移到临床应用的主要障碍。如今，在一项新的研究中，来自美国加州大学伯克利分校、加州大学旧金山分校、格拉德斯通研究所和瑞典阿斯利康公司的研究人员开发出一种可靠的方法来实现这一目
开发出cfMeDIP–seq技术，最低仅需1ng血浆cfDNA就可检测早期癌症
2018年11月15日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，在加拿大玛嘉烈公主癌症中心研究员Daniel De Carvalho博士的领导下，一个研究团队以血液样本作为测试对象，将“液体活检”、甲基化分析和机器学习相结合，开发出一种灵敏的基于免疫沉淀的测试方法来分析少量血浆循环游离DNA（cell-free DNA, cfDNA）中的甲基化组（methylome），从而能够在癌症的最早阶段检
QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年，它描述了“DNA制造RNA，RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前，第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术
许多疾病，例如阿尔兹海默病和帕金森病，都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因，将有助于了解疾病的病因和进展情况，进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向，但是现有方法价格昂贵，且需要专门的设备，严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日，一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破，有望将单个细胞的测序成本降至
Nat Methods：新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中，来自纽约基因组研究中心（NYGC）的研究人员通过研究开发了一种新技术，或能帮助推动单细胞RNA测序的进程，单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域，其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性，同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型，以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源：N
美吉生物 I-Sanger生信云RNA-Seq 2.0上线
“大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼，在生物行业被一家基因测序公司（美吉生物）掀起了一阵巨浪，??将云平台与高通量测序完美结合，为生物信息学的发展带来了无限可能，推动科研服务带入2.0时代。美吉生物 I-Sanger生信云自上线以来得到了科研用户的广泛好评，用户无需配置Linux操作系统，安装复杂的分析软件，下载大量的数据库，只需在I-Sanger生信云平台中选择相应的分析流程和
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动
多亏两种高度类似的技术：一种技术是由美国布罗德研究所的Aviv Regev和同事们开发出的，该技术被称作Perturb-Seq；另一种技术是由以色列魏兹曼研究所的Ido Amit和同事们开发出的，该技术被称作CRISP-Seq。在一项实验中，利用Perturb-Seq、CRISP-Seq或将这两种技术结合在一起研究众多基因扰动是可能的。
Nat Methods：开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法
在一项新的研究中，来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法：将CRISPR集中筛选和按序筛选（arrayedscreen）的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起，他们在单个实验中研究上千个细胞，从而能够平行地确定多种基因的调控影响。
解读单细胞RNA-seq技术
多年来，跟踪一个单细胞的转录组，超出了我们的能力。但是现在，时代已经变了，新的单细胞RNA-seq方法，可以分析大量的细胞及它们的命运。我们都参加过大型生日派对：在拥挤的房间里，与许多人聊天、吃饭和庆祝。但