基于开关电路的DNA计算研究取得进展
近日，中国科学院上海高等研究院光源科学中心物理生物学研究室、中国科学院上海应用物理研究所和上海交通大学合作开发了一种基于DNA链置换反应的开关电路来实现数字运算。与常用的逻辑门电路相比，开关电路结构精简，可以用最少的DNA序列实现高信噪比和快速计算的分子电路。他们展示了迄今为止最为快速的4位平方根运算。相关论文以Implementing digi
华大智造 “超级生命计算机”DNBSEQ-T7 正式交付
2019年9月9日，由深圳华大智造科技有限公司（以下简称“华大智造”）自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用，首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因（WeGene）等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明，T7数据表现符合预期，各项指标均表现良好。作为“全球日生产能力最强”的基因测序仪，DNBSEQ-T7自发布就拥有多个“光环”：“首个4联芯片的测序平台”
PLOS Med：计算机辅助诊断程序让医生更早发现脑肿瘤的生长
2019年6月3日讯 /生物谷BIOON /——根据近日发表在开放获取杂志《PLOS Medicine》杂志上的一项新研究，一种计算机辅助诊断过程可以帮助医生更准确地发现较低级和体积比较小脑部肿瘤的生长，该研究由来自伯明翰阿拉巴马大学的Hassan Fathallah-Shaykh及其同事们一起完成。然而，还需要更多的临床研究来确定早期肿瘤生长检测所支持的早期治疗干预是否能延长患者的生存时间并改善
Gen Res：新型计算机工具有助于基因鉴定
2019年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --就像在大海捞针一样，识别与特定疾病有关的基因可能是一个艰巨而耗时的过程。为了改善这一过程，由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据，并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快，更友好，因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Geno
Sci Rep：计算机成像技术揭示肿瘤内血流信号
2019年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --约翰·霍普金斯大学医学研究人员表示，他们开发了一种类似于“谷歌地图”的方法，可以更准确地计算和可视化肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化。通过将来自动物模型的肿瘤标本的高质量3D成像数据与复杂的数学公式配对，研究人员表示，他们现在拥有一个能够准确表示肿瘤内血液流量的模型，包括复杂的血流量，氧合作用和发生的结构变化。这项工作于3月27日在Nature
基于人工智能和计算机辅助药物设计的研究方法方面获进展
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队，利用人工智能和计算生物学的方法从158万个化合物中寻找到了17个嗅觉受体蛋白Olf73的活性药物分子。该工作为基于嗅觉受体蛋白的药物发现与设计提供了有力的理论基础和依据。该成果以Computational modeling of the olfactory receptor Olfr73 suggests a mo
JCIM：人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗法
2019年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中，来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型，MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。图片来源：theconversation.com当参与细胞增殖的分子信号错误时，癌细胞就
Nat Chem：超级计算机帮助“组装”大型蛋白质复合体
2019年4月1日 讯 /生物谷BIOON/ --红细胞中的血红蛋白分子通过以全有或全无的方式改变其形状来传输氧气。血红蛋白中相同蛋白质的四个拷贝像花瓣一样打开和关闭，在结构上相互耦合以相互作用。使用超级计算机，科学家们能够设计自组装的蛋白质，以组合和类似生命的分子，如血红蛋白。科学家表示，他们的方法可以应用于有用的技术，如药物靶向，人工能量收集，“智能”传感和建筑材料等。一个科学团队通过增加蛋白
Sci Rep：计算机模拟能够预测疟疾的最新表型
2018年9月3日 讯 /生物谷BIOON/ --根据由“la Caixa”基金会支持的ISGlobal领导的一项研究，作者们发现了一类比世界卫生组织（WHO）定义的更严重的疟疾临床表型。结果表明，心力衰竭可能是疾病的致病机制，这对这些患者的临床管理会产生影响。尽管过去几十年取得了一定进展，但根据估计，2016年疟疾仍旧会造成近50万人死亡，其中大部分是儿童。确定严重疟疾的定义是为了确定那些有死亡
Nat Commun：计算机模拟揭示BK通道蛋白调节机制
2018年8月25日 讯 /生物谷BIOON/ --最近，来自马萨诸塞大学安姆斯特分校的计算生物物理学家Jianhan Chen等人通过建模的方式揭示了细胞内大钾离子通道蛋白（BK）的调节机制。 “神经系统传递电信号的主要方式是通过钾离子以及其它例子通道的开启与关闭，其中BK蛋白对于配合肌肉收缩以及神经激活过程中钙离子介导的电信号的传递具有重要的意义”，作者们说道：“BK蛋白含有一个极大