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RNA+DNA同时测序 可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变

 当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因,是大规模探测突变的强有力工具,但在融合/重排检测方面仍具有一定挑战。靶向二代测序是一种能够综合鉴定癌症生物标志的方法,根据不同的变化情况,起始的检测材料可为DNA或

2020-11-20

利用多能性干细胞再生皮肤并揭示一些儿童中的DNA缺陷如何导致鳞状细胞癌

2020年11月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国辛辛那提儿童医院医学中心等研究机构的研究人员利用新的干细胞技术再生和研究活的患者特异性皮肤,从而使得他们能够精确地近距离观察遗传性DNA缺陷如何导致患有范可尼贫血(Fanconi anemia, FA)的儿童和年轻人出现皮肤损伤和致命的鳞状细胞癌。相关研究结果于2020年11月23日

2020-11-28

纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论

 大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa

2020-11-19

安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。

2020-11-23

Andrology:摄入诸如核桃、榛子等多种坚果会改变男性精子DNA的功能 有望改善男性生育力

2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --很多环境和生活方式因素往往与精子质量下降直接相关,而饮食是近年来科学家们发现的最合理的因素之一;此外,多项研究还发现特殊精子DNA甲基化特性的改变或与男性精液质量之间存在密切关联,然而截止到目前为止,并没有研究人员进行随机临床试验(RCT)来评估饮食对精子DNA功能改变的影响。近日,一篇发表在国际杂志An

2020-11-16

PLoS Med:女性孕期的饮食和生活方式或与后代机体DNA的表观遗传学修饰改变直接相关

2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志PLoS Medicine上的研究报告中,来自南安普敦大学等机构的科学家们通过研究发现,肥胖的孕妇或能通过改善饮食和更多的体育锻炼来帮助降低其后代所面临的健康风险;相关研究调查了高糖对妊娠糖尿病女性的影响以及对婴儿机体DNA的改变。如今妊娠糖尿病在全球女性中越来越普遍,而且人群的肥

2020-11-16

Nat Commun:利用机器学习技术或能准确预测抗癌药物的作用效果

2020年11月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自韩国浦项科技大学等机构的科学家们通过研究表示,利用机器学习技术或能有效预测抗癌药物的治疗疗效。目前,随着药物基因组学的出现和发展,研究人员就能利用此前收集的患者对药物反应的数据所衍生的算法,进行机器学习研究来帮助预测不同患

2020-11-04

Circ Arrhythm Electrophysiol: 机器学习精确揭示心律不齐的原因

近日,Skoltech研究所的科学家们设计了一种新的基于机器学习的方法,用于检测“心房颤动驱动器”,即被认为会导致最常见类型的心律不齐的心肌小斑块。据美国心脏协会称,这种方法可能导致更有效的针对性医疗干预,以治疗估计影响全球3300万人的疾病。

2020-11-01

研究阐述血液中细胞特异性的DNA甲基化改变

 近期,中国科学院上海营养与健康研究所(中国科学院-马克斯·普朗克科学促进学会计算生物学伙伴研究所)研究员Andrew Teschendorff课题组与研究员汪思佳课题组合作,在Nature Communications上,在线发表题为A cell-type deconvolution meta-analysis of whole blood EW

2020-11-01

研究观测染色质重塑中DNA的B-Z构象转变

 近年来,Z型DNA(Z-DNA)的研究引发关注,但是在细胞中对其进行观测还存在困难,主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作,利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变,相关研究成果发表在Analytical Chemistry上

2020-11-01