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Nature:推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris

2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub),弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库(网址:https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/)。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single

2018-10-05

两篇Nature论文聚焦英国生物样本中的基因组和表型数据

2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文,描述了使用英国生物样本库(UK Biobank)中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库,从中寻找遗传变异和表型之间的关联性,以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据

2018-10-13

升级版环形RNA数据库网站发布

  近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati

2018-09-20

科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库

2018年1月5日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。图片来源:www.thoughtco.com代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围环境之间的相互

2018-01-05

中国科学家构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库

 创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder,PTSD)发生在创伤事件暴露后,是具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》中,PTSD已从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的必要条件之一,关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明,70%的受访者至少报告了一例创伤事件,但其中只有少数人

2017-12-05

中国科学家发布表观基因组数据库MethBank 3.0

中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分,DNA甲基化

2017-12-03

首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库发布

 11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations为题,在线发表在《核酸研究》上。该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类

2017-11-16

英国顶级专业期刊《核酸研究》发表史上最强翻译组学数据库

11月3日,英国Oxford出版社核心生物期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》,最新影响因子10.162)发表了承启生物联合创始人张弓等共同完成的基于云计算分析平台的TranslatomeDB数据库,文章标题为“Translatome DB: a comprehensive database and cloud-based analysis platform for tr

2017-11-06

复旦大学发表首个人类血液外泌体长链RNA数据库

最近Nucleic Acids Research杂志在线发表了首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase(www.exoRBase.org),收录了上万条环状RNA(circRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA。该数据库由复旦大学附属肿瘤医院/肿瘤研究所(复旦肿瘤所)黄胜林课题组完成,这是该课题组继2015年Cell Research首次报道环状RNA富集于外泌体并存在于血

2017-10-25

Cell Systems:大型基因组数据库分析或能帮助寻找和未来疾病发病风险相关的遗传突变

2017年9月14日 讯 /生物谷BIOON/ --如今,临床医生们会越来越多地使用遗传测试技术来寻找罕见疾病患者的发病原因,但寻找到病因仅仅是我们对抗疾病战斗的一部分,基因组分析的下一个前沿领域就是预测遗传突变是否是引发疾病的先兆。近日,一项刊登在国际杂志Cell Systems上的研究报告中,来自哈佛医学院的研究人员通过研究开发出了一种新方法,这种方法能够增加研究人员预测遗传突变作为疾病病因的

2017-09-14