SDR-seq高通量解析遗传变异对基因表达的精细调控
SDR-seq技术的出现,为我们提供了一个前所未有的新“罗盘”。它不仅能将我们精确地导航到那片森林,还能让我们直接走进每一户人家,亲眼看到他们的炉灶 (基因型) 和锅里煮着的食物 (基因表达)。
Science子刊:新研究表明增强CD4+ T细胞中的AST表达可让HIV进入休眠状态
这些新发现可能为HIV感染者开发通过永久增强T细胞中AST的表达从而使这种病毒处于长期休眠状态的基因疗法提供依据。
Science:新型人工智能工具模拟蛋白质动力学,助力药物发现和蛋白质研究
BioEmu将超过200毫秒的分子动力学模拟与实验数据相结合,以接近实验的精度预测结构集合和热力学性质。
Science:利用人工智能揭示蛋白质稳定性规则,有望推进蛋白质工程变革
蛋白质稳定性遵循的规则比之前认为的更简单,这一证实可以大幅减少蛋白质设计的试错阶段,为开发具有医疗或工业应用的蛋白质(如更环保的催化剂或更持久的药物)节省大量时间和精力。
攻克“不可成药”,David Baker团队中国博后利用AI从头设计蛋白,靶向内在无序蛋白,解锁治疗靶点
这两项研究中,研究团队采用了两种互补的设计策略,这两种策略基于氨基酸序列,而无需蛋白结构信息,因此,有助于在大量新的治疗靶点上实现高度通用的药物发现。
Nat Chem Biol:发现tau蛋白和β淀粉样蛋白之间的通信可以减轻阿尔茨海默病的毒性
在这项研究中,团队结合了精密分析技术,包括光谱学、质谱分析、等温滴定量热法和核磁共振,与基于细胞的毒性检测,全面分析了tau-Aβ相互作用的结构、热力学和功能特性。
Nature:深度视觉蛋白质组学揭示肝脏疾病中的蛋白质毒性新机制
本文研究通过深度视觉蛋白质组学技术为AATD的病理机制提供了全新的视角,相关研究结果不仅揭示了蛋白质毒性的分子基础,还为未来开发新型治疗策略提供了潜在的靶点。
会“变身”的弹性蛋白纳米粒,打破细胞递送壁垒,蛋白、核酸一网打尽
研究表明,ENTER系统不仅能在体外将蛋白质、siRNA、mRNA和基因编辑工具高效、低毒地递送进多种细胞类型,包括关键的原代细胞,甚至在活体动物(小鼠肺部)中也成功实现了基因编辑!
Nature系列综述:乔治·丘奇绘制 AI 蛋白质设计路线图,逐步指导利用AI工具设计蛋白质
该综述的核心是提供一个全面且可操作的蛋白质设计路线图,逐步指导如何将最先进的 AI 工具整合到蛋白质设计工作流程中,包括结构与功能预测工具以及用于从头设计的生成式模型。
David Baker团队开发新型AI蛋白设计模型——LigandMPNN,实现原子上下文条件蛋白序列设计
研究团队开发了一种新型深度学习方法——LigandMPNN,该方法明确地对生物分子系统中的所有非蛋白质成分进行了建模。