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  • 国家微生物科学数据中心:打造全球核心数据库

      “目前,国家微生物科学数据中心数据资源总量已超过300TB,数据记录数超过了40亿条。”世界微生物数据中心主任、国家微生物科学数据中心主任马俊才在接受科技日报记者采访时介绍说,中心的数据内容完整覆盖微生物资源、微生物及交叉技术方法、研究过程及工程、微生物组学、微生物技术,以及微生物文献、专利、专家、成果等微生物研究的全生命周期。今年6月份,科技部、财政部联合发布国家科技资源

  • 科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0

     非编码RNA对生物分子的调控作用,一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中,非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用,调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日,《核酸研究》(Nucleic Acids

  • 研究开发表观组关联分析数据库

    近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,表观组关联分析(Epigeno

  • 研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库

    10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse populations 为题,在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所/马普计算生物学研究所徐书华团队基于20万人

  • 多国科学家合作构建全球最大人体微生物组数据库

      10月26日,“百万微生态”国际合作计划(MMHP)在深圳第14届国际基因组学大会(ICG-14)上正式启动,来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究,致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析,绘制人体微生物组图谱,构建起全球最大的人体微生物组数据库。在启动仪式上,瑞典卡罗林斯卡医学院

  • 研究揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库

    近日,中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作,系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器(baseeditor)的效能差异,并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库(BEable-GPS, Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs),相关成

  • 我国建成首个志愿军烈士DNA数据库

     今年烈士纪念日前夕,退役军人事务部在沈阳抗美援朝烈士陵园举行了中国人民志愿军烈士认亲仪式。这是我国首次通过DNA技术手段确定无名志愿军烈士遗骸身份。记者13日获悉,承担此项任务的是军事科学院军事医学研究院王升启团队。他们突破了从陈旧遗骸中提取严重降解微量DNA、复杂亲缘关系身份鉴定等国际难题,首次建立了具有三种遗传标记类型的志愿军烈士遗骸和亲属DNA数据库,为认亲比对提供了可靠的技术和

  • “垃圾基因”数据库收获全球遗传学家“粉丝”

     “打个比喻,如果我们的遗传信息是一座山,遗传学家知道这山里面有金子,但他们用的是锄头。我们的工作就是给他们打造‘挖矿机’,帮他们把这些金子更快地挖出来;并把我们已经挖到的东西展现出来,构建成资源库,方便他们使用。”华中农业大学信息学院、生物医学与健康学院教授龚静这样解释他们的研究。龚静的团队最近在英国《核酸研究》杂志先后发表3篇文章。他们通过对多种癌症中遗传变异的功能进行深入分析,发现

  • 美年健康建超声大数据库,引领预防医学数字化

    近日,在杭州召开的超声大数据与人工智能应用与推广大会上,大数据算法与分析国家工程试验室杭州创新中心、浙江省数理医学学会、美年健康三方在超声人工智能方向达成合作,共建超声大数据库。预防医学AI有先天优势据悉,作为中国最大的预防医学龙头企业,美年健康已经覆盖全国31个省市自治区、301座核心城市,布局633家体检中心(含在建)。2018年为超过3000万人次提供专业健康服务,这一数字有望在2019

  • 南京农大构建世界首个植物重复基因数据库

     2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。植物在千百年的进化中,怎样变得越来越多姿多彩?一个重要因素就是植物会复制自己基因,丰富自己的基因库数量。团结起来力量大,多了自己的“同胞胎”兄弟姐妹,基因在生物体中就