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单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

Genome Medicine:浙江大学良渚实验室沈宁团队发布实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与表达异质性的同步研究算法

该研究为癌症领域单细胞水平基因型与表型关联的异质性与进化研究提供方便有效的工具,为临床诊断提供新的方向。

2023-12-27

入选年度最佳Cell论文,蔡立慧团队在单细胞层面解析阿尔茨海默病的复杂性

该封面以瓷砖的形式展示了大脑中脑细胞和基因组的组织系统结构,随着疾病的发展,基因组组织随着神经元退化和小胶质细胞激活而被侵蚀和打乱,反映了阿尔茨海默病对大脑细胞和分子景观的破坏性影响。

2024-01-11

Nature:李冲等通过单细胞大脑类器官筛查自闭症发育缺陷

除了为自闭症研究提供无与伦比的新见解外,研究团队还强调了CHOOSE系统的通用性和可转移性。论文通讯作者 Juergen Knoblich 教授表示,预计这项技术将被广泛应用于大脑类器官以外,以研究各

2023-09-15

Science:利用CRISPR和单细胞测序精确确定性状和疾病的因果遗传变异

在一项新的研究中,来自美国纽约大学和纽约基因组中心的研究人员开发出一种新方法,将遗传关联研究、基因编辑和单细胞测序结合起来,以应对这些挑战并发现血细胞性状的因果变异(causal variants)和

2023-05-23

Sci Transl Med:科学家有望利用单细胞基因组学技术来加速人类肺部疾病药物的开发

来自德国的科学家们利用新型实验模型来研究肺部疾病,即所谓的人类精确切割肺部切片,这些是肺部组织的薄片,或能用于实验室的研究中。

2023-12-13

福建医科大学许艳芳团队通过单细胞测序揭示不同病因急性肾损伤细胞病理机制

急性肾损伤是一种复杂的全身性疾病,也是危重病患者的常见并发症。目前的研究表明,AKI使慢性肾脏疾病(CKD)的风险增加近8-10倍,使其成为CKD发病的主要风险因素。

2023-05-30

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

Nat Biotechnol | 北京大学伊成器等团队合作开发同时对5mC和5hmC进行单细胞分析的新方法

该研究提出SIMPLE-seq(通过测序同时分析表观遗传胞嘧啶修饰),用于在单细胞和单碱基分辨率下联合分析5mC和5hmC。

2024-02-14

EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制

果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细

2023-08-24