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科研人员研发出磁共振脑影像一键式数据处理与分析软件平台

 功能磁共振成像(Functional magnetic resonance imaging,fMRI)技术被广泛应用于有关认知、情绪、发展和脑功能障碍的脑科学研究中。然而,传统的基于三维体空间的磁共振分析方法可能导致部分容积效应,即一个三维的脑区可能同时包含来自灰质、白质,甚至脑脊液的信号。研究发现人类脑功能是以大脑皮层表面的形式组织起来的,因此

2021-10-22

科研人员开发细菌全基因组规模预测IV型分泌系统效应蛋白的新软件

近日,上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室在生物信息学顶级刊物《Briefings in Bioinformatics》(IF:11.622)上发表题为“T4SEfinder: a bioinformatics tool for genome-scale prediction of bacterial type IV secreted eff

2021-10-22

Science:利用新型人工智能软件工具RoseTTAFold仅需10分钟就可准确地计算出蛋白质三维结构

2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---自从DeepMind在2020年的“结构预测关键评估(Critical Assessment of Structure Prediction)”(CASP14)会议上展示了该领域的显著进展以来,科学家们已经等待了数月,以获得高度准确的蛋白质结构预测的机会。现在等待已经结束。在一项新的研究中,来自美国多个研究机构

2021-07-17

NAR:科学家开发出一种能识别肿瘤和其微环境中特殊细胞类型的新型软件

2021年7月13日 讯 /生物谷BIOON/ --随着高通量基因组学检测变得更为有效且能产生一定的成本效益,使用该技术已经成为大规模生物医学研究计划的标准,这些研究通常是探索性的,因为样品之间的关联并不是之前已经明确的,而是从数据驱动的分子亚型的发现和注释中产生的,从而就为假设和独立性评估提供了一定的信息。在疾病、生物体和生物过程中发现新的群体或类别,并将

2021-07-12

全力打造慢病全病程管理创新模式,赛诺菲慢病管理创新项目落地浦东软件

2020年11月8日,赛诺菲持续深入拓展与外部各界伙伴跨领域合作,全力打造具有中国特色、适合中国国情的慢病管理创新模式。今天在第三届中国国际进口博览会现场再传佳音——赛诺菲中国宣布与上海浦东软件园创业投资管理有限公司达成战略合作,将在浦东软件园孵化空间落地赛诺菲慢病管理创新项目,探索业界领先的慢病全病程管理创新模式。

2020-11-08

细胞器基因组组装软件开发研究取得进展

真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体(包括叶绿体、白色体等)的全部DNA分子,是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内,有多个(甚至成千上万个)细胞器基因组单元的拷贝,使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展,测序成本下降,低覆盖度的全基因组测序数据得以大规模产生,如何快速、准确地组装细胞

2020-09-16

深圳硅基的糖网AI辅助诊断软件获中国首批三类证

2020年8月7日,由深圳硅基智能科技有限公司(简称“深圳硅基”)成功研发的具有自主知识产权的医学影像人工智能辅助诊断产品——“糖尿病视网膜病变眼底图像辅助诊断软件”(简称“糖网AI辅助诊断软件”),获批国家食品药品监督管理局三类医疗器械,成为中国首批获批上市的基于深度学习技术的眼底病变辅助诊断软件

2020-08-11

Genome Bio:新型软件能够识别癌细胞基因融合

经过多年的开发,St Jude儿童医院的研究人员首次公开了一个新型软件系统,该软件系统可以更好地检测基因融合情况。该系统称为CICERO,可提供有关癌症的更多信息以及药物治疗的新靶点。 相关结果发表在最近的《Genome Biology》杂志上。

2020-06-16

研究人员开发高质量基因组组装软件

11月25日,中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale contigs by efficiently resolving

2019-12-08

开发出具有人类能力的人工智能软件 或能分析显微镜图像中宿主与病原体的相互作用

2019年5月28日 讯 /生物谷BIOON/ --称之为神经网络的计算系统基于生物大脑的学习过程,其能够实现一种机器学习形式,有助于帮助研究人员解读生物和医学成像,如今研究病原体与宿主细胞相互作用的科学家们已经开始利用这种这种技术从事相关研究了。图片来源:GEORGE RETSECK来自英国克里克研究所的研究者Eva Frickel表示,从事病原体-宿主相互作用研究领域的大部分人群都只是手动计数

2019-05-28