崔大伟：Hsp90α是一种新的肿瘤标志物
肿瘤标志物是一类反映肿瘤存在的物质，在肿瘤患者体内的含量远远超过健康人群。与其他肿瘤检测手段相比，肿瘤标志物更加方便快捷，成本也大大降低，现已成为肿瘤诊断、预后及治疗指导中的重要辅助手段。至今尚无我国自主发现的肿瘤标志物在临床中被广泛应用和认可。
人热休克蛋白90α（Hsp90α）是热休克蛋白家族中的重要成员，广泛存在于从细菌到哺乳动物的各类细胞中。清华大学罗永章教授课题组在世界上首次报道了肿瘤细胞特异分泌Hsp90α的调控机理，同时首次揭示了细胞外Hsp90α与细胞内Hsp90α的分子差异，并进一步证明了分泌型Hsp90α能促进肿瘤侵袭及转移，且其在血液中的含量与肿瘤恶性程度正相关。该课题组经过多年攻关，解决了一系列技术难题，成功研发出了性能稳定的“Hsp90α定量检测试剂盒”，并完成了世界上首个Hsp90α作为肿瘤标志物的临床试验，成功证明了Hsp90α是肺癌相关肿瘤标志物，可用于患者病情监测和疗效评价。
该成果是抗肿瘤蛋白质药物国家工程实验室的一项重要成果，为产学研结合的科研运行模式树立了一个成功典范。
低成本基因标志物检测新方法及其装置
检测具有生物学意义的基因序列、基因突变与基因表达量是分子诊断的重要内容。通常先对目标序列进行扩增，然后采用特异性的方法捕获待检靶标，最后通过光电等手段将捕获的靶标转换成可读信号，实现基因标志物的检测。检测成本主要体现在检测试剂、检测人力与检测装置。为了降低检测成本，本课题组提出了新的低成本靶标捕获与检测方法，采用裸眼即可检测，无需使用荧光标记探针；通过将序列扩增与靶标捕获、信号读出等一体化，在单管中完成扩增与检测全部过程，极大降低了人工操作时间。加入样本就可自动给出结果，无需昂贵的仪器装置，仅需一台普通的PCR仪。同时，为了避免可能的人为误差，我们又研制了低成本微量可见分光检测系统，用以检测扩增产生的信号。本方法已经成功用于病原微生物检测、个体化用药相关基因标志物检测，表明我们研制的新方法能够实现低成本基因序列差异和突变的检测。
田亚平：新的肿瘤血液生物标志：microRNA
MicroRNA（miRNA）是一类生物体内长度约22个左右核苷酸的小RNA，相关研究显示其广泛存在于多种体液中，且可稳定存在较长时间。miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用，一个miRNA可以调节多个靶基因的表达，而几个miRNAs也可同时调节一个基因。
恶性肿瘤的发生发展过程非常复杂，常常涉及多个基因的表达异常，因此miRNA复杂调节网络的紊乱与细胞增殖和凋亡过程的调节失控可能存在一定关联。
为此我们利用芯片和 Solexa 测序技术筛选肿瘤相关miRNA，在血液中发现了一些与原发性肝癌、宫颈癌、肺癌等密切相关的miRNA，经Q-PCR方法临床验证，初步证明其具有一定辅助诊断价值，进一步研究可为恶性肿瘤的生物靶向治疗提供新的线索与靶点。
许国旺：从组织和体液看肿瘤代谢紊乱：代谢分型和标志物发现
癌的典型特征之一是代谢的高度紊乱。研究肿瘤相关组织微环境和体液代谢紊乱的状况将对疾病的分型、诊断、标志物的发现等具有重要意义。代谢组学作为功能基因组学和系统生物学研究不可或缺的重要组成部分，近年来在疾病、药物、植物基因功能和表型的研究等方面显示出了极大的潜力。
结合本实验室10多年在代谢组学的研究工作，将从代谢组学的需求出发，报告基于质谱的代谢组学新技术及在恶性肿瘤（肝癌、卵巢癌等）的分型、潜在标志物发现方面的应用结果，同时代谢组学研究对样本采集标准化的要求将被强调。
覃文新：DKK1蛋白作为肝癌血液标志物的发现和转化研究
上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所癌基因及相关基因国家重点实验室
肝细胞癌是全球致死率较高的恶性肿瘤之一，及时有效的诊断可提高患者的临床治疗效果、延长生存时间。
本研究纳入两个队列：测试集和验证集，测试集共831例血清样本，验证集共453例血清样本。采用酶联免疫吸附实验测定DKK1在血清中的浓度，并根据受试者工作特征曲线分析其对肝细胞癌的诊断价值。
结果显示：DKK1蛋白在肝细胞癌患者组血清中的浓度明显高于非癌症组；血清DKK1蛋白对肝细胞癌总体诊断率可达69.1%，对早期肝细胞癌（BCLC 0+A）和小肝癌（单个小于2cm）的诊断率分别可达70.9%和58.5%；同时，DKK1蛋白能够弥补甲胎蛋白（AFP）对肝细胞癌诊断能力的不足，对甲胎蛋白阴性（≤20ng/ml）肝细胞癌的诊断率为70.4%，并可从甲胎蛋白阳性（>20ng/ml）的慢性乙型肝炎及肝硬化等高危患者中鉴别诊断肝细胞癌，鉴别诊断率达68.2%；DKK1蛋白与甲胎蛋白联合应用，可将肝细胞癌总体诊断率提高至87.5%。
验证集验证了血清DKK1蛋白对肝细胞癌的诊断价值,手术后患者血中的DKK1浓度迅速下降，血清DKK1蛋白亦可作为肝癌疗效监测和预后判断指标（The Lancet Oncology 2012 Aug; 13(8):817）。
发展绿色荧光蛋白作为一种生物标志物
Chalfie描述的事件，都是偶然的和有见地的, 这导致GFP的发现和发展作为标记基因的表达。他还提出了一个强有力的论点的重要性在运动科学前沿的基础研究。
耽美玉：激酶抑制疗效监控标志物研究
介绍了敏感标志物在加快药物研发进程中发挥的重要作用，介绍了肿瘤药物治疗的困境：临床响应率依然有限、获得耐药性容易发生、原发性耐药广泛存在。介绍了需要关注的科学问题：理性靶点群VS联合用药策略、肿瘤细胞自身VS肿瘤免疫微环境。介绍了4个同步策略。介绍了高选择性C-Met抑制剂SCC244-疗效监控标志物的研究。
秦胜营：中国人群药物反应生物标志物的发现与验证
介绍了中国人群药物反应分子标记物的发现与确认，提到了基因相关的药物严重副作用。对比了美国与中国药物不良反应危害。提到了药物的种群差异和基因差异。提到了第八届国际皮肤药物不良反应大会。肿瘤药物基因组学研究以及个体化医学中的一系列里程碑性事件。临床复杂性疾病药物基因组学研究。介绍了基于药物代谢酶微粒体的新药安全性评价微流控芯片。
李松丽：精准医疗之蛋白生物标志物的发现，优化，验证和应用
介绍了精准医学的一些内容，提到了蛋白质生物标志物发现流程，提到了生物标志物高通量检测的必要性及应用；基于免疫反应的高通量检测技术；血清中肾脏标志物的筛选；引起免疫反应实验非重复性的原因。提到了Luminex技术在白血病抗药机理研究中的应用。
田小利：内皮细胞衰老的标志物及其可能的程序设计
介绍了中国平均年龄趋势，提到了年龄相关的一些研究，包括年轻的血液对于老年疾病的影响。细胞水平上关于编码基因的研究。提到了研究的重点，基因编码和血管影响。研究的目标：延缓疾病的发生，延长寿命。