Clin Infect Dis: 研究帮助预测COVID19检测假阴性率
来源:本站原创 2021-02-23 22:50
即使每天有超过150万美国人接受COVID疫苗,官员们估计,要使足够的人受到保护,还需要花费更多的时间。在此之前,甚至可能以后,专家们一致认为,要想安全地开放学校,饭店和其他公共场所,依赖于对SARS-CoV-2的广泛检测。
2021年2月24日讯/生物谷BIOON/---即使每天有超过150万美国人接受COVID疫苗,官员们估计,要使足够的人受到保护,还需要花费更多的时间。在此之前,甚至可能以后,专家们一致认为,要想安全地开放学校,饭店和其他公共场所,依赖于对SARS-CoV-2的广泛检测。
截至2020年6月,美国食品药品监督管理局(FDA)已授予紧急使用许可,用于超过85种不同的病毒DNA测试试剂盒,每种试剂盒的灵敏度各不相同,准确率未知。但是,由于目前尚无针对新型冠状病毒的金标准测试,因此很少有数据可以判断这些测试对市政当局安全地重新营业的努力是否有用。
(图片来源:Www.pixabay.com)
贝斯以色列女执事医学中心(BIDMC)的一组研究人员开发了一种数学方法来评估测试的假阴性率。该团队的方法可以对各种试验的临床敏感性进行逐一比较,并发表在《Clinical Infectious Diseases》杂志上。
“为了继续照常营业,我们都同意,我们必须加大测试力度,以找出谁是阴性和谁是传染病,但这只有在您能抓住所有积极情况的情况下才能发挥最佳作用,” BIDMC临床微生物实验室主任,医学博士James E. Kirby说道:“我们发现这些检测试剂盒之间的临床敏感性差异很大,这对正在进行的大流行的患者护理,流行病学以及社会和经济管理具有明显的意义。”
BIDMC临床微生物学实验室副主任Ramy Arnaout博士说:“这些结果特别重要,因为我们从测试大多数有症状的人过渡到整个社区进行更常规的筛查。 “假阴性率取决于所使用的测试。通过我们的模型,我们可以更好地了解这些人被传染的可能性。”
使用2020年3月26日至5月2日在Beth Israel Lahey Health医院站点进行的超过27,000次COVID-19测试的数据,Arnout的Kirby和同事首先证明了病毒载量报告可靠性。 Arnaout说:“这在极端情况下有助于将潜在的超级传播者与正在康复的人区分开来,他们几乎没有病毒,因此传播感染的可能性很小。”
接下来,研究人员首先估计了内部测试的临床敏感性和假阴性率,这是在全国范围内率先实施的测试,被认为是同类产品中最好的。分析近5,000名测试阳性患者的重复测试结果,研究人员可以确定内部测试在大约10%的病例中出现了假阴性,因此该方法的临床敏感性约为90%。
为了评估其他测定的准确性,研究小组基于每个测试的检测限或LoD(其定义为检测可捕获95%或更多的时间可检测到的最小病毒DNA量)来进行计算。
Arnaout,Kirby及其同事证明了检测限可以用作估计给定测定法临床敏感性的替代方法。根据研究小组的计算,每毫升检测到1,000份病毒DNA的检测限预计将仅检测出75%的COVID-19患者,从而四分之一的人的检测结果可能为假阴性。研究小组还显示,当今市面上的一项检测会错过三分之二的受感染个体,而另一项测试可能错过了多达60%的阳性病例。
Arnaout说:“这些假阴性将对公共卫生工作造成影响,并使患者及其接触者处于危险之中。我们真的需要对每个新测试进行基准测试,即使是在急于提高测试能力以了解它们对我们的测试目标的支持程度方面也是如此。”(生物谷 Bioon.com)
接下来,研究人员首先估计了内部测试的临床敏感性和假阴性率,这是在全国范围内率先实施的测试,被认为是同类产品中最好的。分析近5,000名测试阳性患者的重复测试结果,研究人员可以确定内部测试在大约10%的病例中出现了假阴性,因此该方法的临床敏感性约为90%。
为了评估其他测定的准确性,研究小组基于每个测试的检测限或LoD(其定义为检测可捕获95%或更多的时间可检测到的最小病毒DNA量)来进行计算。
Arnaout,Kirby及其同事证明了检测限可以用作估计给定测定法临床敏感性的替代方法。根据研究小组的计算,每毫升检测到1,000份病毒DNA的检测限预计将仅检测出75%的COVID-19患者,从而四分之一的人的检测结果可能为假阴性。研究小组还显示,当今市面上的一项检测会错过三分之二的受感染个体,而另一项测试可能错过了多达60%的阳性病例。
Arnaout说:“这些假阴性将对公共卫生工作造成影响,并使患者及其接触者处于危险之中。我们真的需要对每个新测试进行基准测试,即使是在急于提高测试能力以了解它们对我们的测试目标的支持程度方面也是如此。”(生物谷 Bioon.com)
原始出处:Arnaout et al,The Limit of Detection Matters: The Case for Benchmarking Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Testing. Clinical Infectious Diseases. academic.oup.com/cid/advance-a … cid/ciaa1382/6127024 , DOI: 10.1093/cid/ciaa1382/6127024
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