Cell:科学家鉴别出多个癌症驱动子,但有些被忽视的“乘客突变子”也很重要!
来源:本站原创 2020-03-09 21:59
2020年3月7日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Cell上的研究报告中,来自耶鲁大学等机构的科学家们通过对38种不同类型的2658名患者进行完整基因组的大规模分析后发现,179个基因和基因调节子(驱动子)的突变或会导致癌症的发生。图片来源:CC0 Public Domain这项研究是PCAWG(Pan-Cancer Analysis
2020年3月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Cell上的研究报告中,来自耶鲁大学等机构的科学家们通过对38种不同类型的2658名患者进行完整基因组的大规模分析后发现,179个基因和基因调节子(驱动子)的突变或会导致癌症的发生。
图片来源:CC0 Public Domain
这项研究是PCAWG(Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes,泛癌全基因组分析)计划的一部分,尽管驱动子在所分析的癌症病例中占到了很大一部分比例,但研究者并未解释其中的原因,研究者认为,要想全面了解癌症的进展就需要更多的不仅关注经典的遗传驱动子,还要多关注一下“乘客”(passengers),即在一个典型癌症基因组中观察到的组成绝大多数突变的成千上万个非驱动的突变;从历史上来讲,研究界认为这些“乘客突变”在肿瘤生长中并没有作用。
研究者Gerstein教授说道,其中很多突变对癌症的发展或许会产生小的个体效应,但并未出现可观的累积效应;理解健康细胞如何形成癌细胞、癌细胞的复制、如何迁移到不同器官背后的遗传根源,以及不同类型肿瘤和不同个体之间的差异对于设计新型疗法来抵御癌症至关重要。文章中,研究者想通过研究揭示是否这些乘客突变能够帮助解释10%的癌症病例,即研究者在这些患者机体中很少或并未发现明确的遗传驱动子,他们发现,一类乘客突变或会对基因组区域产生显著影响,其程度与驱动子相当,总体上也会对肿瘤的生长产生显著影响。
此外,研究人员还对8种不同类型的癌症进行了一项重点的统计学分析,结果表明,这些乘客突变对癌症发生的累积效应超出了驱动子单独作用的影响范围;总的来讲,在预测既定样本是否会发生癌变方面,乘客突变带来了额外9%的贡献。最后研究者Gerstein强调道,其中某些乘客突变实际上还能帮助有效阻碍癌症的发展,而不是诱发肿瘤生长;理解这些乘客突变所扮演的关键角色或能帮助研究人员开发新型疗法从而靶向作用特殊患者癌症基因组的单一突变,从而有效应对癌症。(生物谷Bioon.com)
原始出处:
Kumar S, Warrell J, Li S, et al. Passenger Mutations in More Than 2,500 Cancer Genomes: Overall Molecular Functional Impact and Consequences. Cell. 2020 Feb 14. pii: S0092-8674(20)30113-6. doi: 10.1016/j.cell.2020.01.032
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