Nature：重大进展！新研究揭示常见的SF3B1基因突变如何导致癌症
来源：本站原创 2019-10-17 13:28
2019年10月17日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国弗雷德哈金森癌症研究中心和纪念斯隆凯特琳癌症中心等研究机构的研究人员确定了SF3B1（splicing factor 3b subunit 1, 剪接因子3b亚基1）基因突变如何促进很多癌症形成，其中SF3B1是最为频繁发生突变的剪接因子编码基因。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“Spliceosoma
2019年10月17日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国弗雷德哈金森癌症研究中心和纪念斯隆凯特琳癌症中心等研究机构的研究人员确定了SF3B1（splicing factor 3b subunit 1, 剪接因子3b亚基1）基因突变如何促进很多癌症形成，其中SF3B1是最为频繁发生突变的剪接因子编码基因。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“Spliceosomal disruption of the non-canonical BAF complex in cancer”。论文通讯作者为弗雷德哈金森癌症研究中心的Robert Bradley博士和纪念斯隆凯特琳癌症中心的Omar Abdel-Wahab博士。
这些研究人员发现了SF3B1基因突变如何导致癌症，这些突变发生在许多癌症类型中，包括各种白血病、骨髓增生异常综合征、黑色素瘤、乳腺癌、胰腺癌、肝癌和膀胱癌。
鉴于SF3B1编码的蛋白对于产生RNA分子至关重要，因此Bradley和Abdel-Wahab研究了来自数百名患有几种不同癌症类型的患者的RNA测序数据，以寻找异常的RNA分子。他们发现SF3B1突变导致癌细胞产生异常形式的BRD9 RNA分子，它包括非编码DNA序列或者说“垃圾DNA”。这种“垃圾DNA”源自近期将自身插入人类基因组的病毒序列元件。 Bradley和Abdel-Wahab发现BRD9在许多类型的癌症中都是重要的肿瘤抑制因子，这些癌症包括葡萄膜黑色素瘤（一种影响眼睛的黑色素瘤类型）、慢性淋巴细胞性白血病和胰腺癌。他们随后利用CRISPR技术和反义寡核苷酸设计了可逆转这种疾病过程的疗法。
Bradley说：“我们知道许多导致癌症的基因突变，尤其是SF3B1基因突变与许多癌症类型密切相关。目前尚不清楚为何SF3B1基因突变如此普遍，而且也不知道如何最好地确定治疗方案。得益于测序技术、计算能力和CRISPR基因组工程技术取得的突破，我们得以发现SF3B1突变如何导致癌症，以及如何潜在地阻断癌症进展。”
尽管这项新的研究是临床前研究（尚未在人体中进行过测试），但是这些研究人员指出靶向药物有可能帮助携带SF3B1基因突变的癌症患者。
Abdel-Wahab说：“作为一名临床医生，通过修饰细胞中的分子来减缓或防止患者肿瘤生长的想法确实令人兴奋。基于患者的个体遗传特征开发新的靶向疗法是精准医学突破的关键。”
Bradley和Abdel-Wahab希望将他们的研究工作扩展到原理验证实验之外，并通过其他癌症类型以及最终的临床治疗来测试他们的观点。几种反义寡核苷酸疗法，比如Bradley和Abdel-Wahab开发出的一种这样的疗法，近期获得了美国食品药品管理局（FDA）的批准，这表明他们的治疗方法可能可用于治疗患者。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Daichi Inoue et al. Spliceosomal disruption of the non-canonical BAF complex in cancer. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1646-9.
2.New research uncovers how common genetic mutation drives cancer
https://medicalxpress.com/news/2019-10-uncovers-common-genetic-mutation-cancer.html
图片来自Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1646-9。
这些研究人员发现了SF3B1基因突变如何导致癌症，这些突变发生在许多癌症类型中，包括各种白血病、骨髓增生异常综合征、黑色素瘤、乳腺癌、胰腺癌、肝癌和膀胱癌。
鉴于SF3B1编码的蛋白对于产生RNA分子至关重要，因此Bradley和Abdel-Wahab研究了来自数百名患有几种不同癌症类型的患者的RNA测序数据，以寻找异常的RNA分子。他们发现SF3B1突变导致癌细胞产生异常形式的BRD9 RNA分子，它包括非编码DNA序列或者说“垃圾DNA”。这种“垃圾DNA”源自近期将自身插入人类基因组的病毒序列元件。 Bradley和Abdel-Wahab发现BRD9在许多类型的癌症中都是重要的肿瘤抑制因子，这些癌症包括葡萄膜黑色素瘤（一种影响眼睛的黑色素瘤类型）、慢性淋巴细胞性白血病和胰腺癌。他们随后利用CRISPR技术和反义寡核苷酸设计了可逆转这种疾病过程的疗法。
Bradley说：“我们知道许多导致癌症的基因突变，尤其是SF3B1基因突变与许多癌症类型密切相关。目前尚不清楚为何SF3B1基因突变如此普遍，而且也不知道如何最好地确定治疗方案。得益于测序技术、计算能力和CRISPR基因组工程技术取得的突破，我们得以发现SF3B1突变如何导致癌症，以及如何潜在地阻断癌症进展。”
尽管这项新的研究是临床前研究（尚未在人体中进行过测试），但是这些研究人员指出靶向药物有可能帮助携带SF3B1基因突变的癌症患者。
Abdel-Wahab说：“作为一名临床医生，通过修饰细胞中的分子来减缓或防止患者肿瘤生长的想法确实令人兴奋。基于患者的个体遗传特征开发新的靶向疗法是精准医学突破的关键。”
Bradley和Abdel-Wahab希望将他们的研究工作扩展到原理验证实验之外，并通过其他癌症类型以及最终的临床治疗来测试他们的观点。几种反义寡核苷酸疗法，比如Bradley和Abdel-Wahab开发出的一种这样的疗法，近期获得了美国食品药品管理局（FDA）的批准，这表明他们的治疗方法可能可用于治疗患者。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Daichi Inoue et al. Spliceosomal disruption of the non-canonical BAF complex in cancer. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1646-9.
2.New research uncovers how common genetic mutation drives cancer
https://medicalxpress.com/news/2019-10-uncovers-common-genetic-mutation-cancer.html
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