Nat Commun：利用AIOD-CRISPR超灵敏地可视化检测新冠病毒
来源：本站原创 2020-09-26 11:34
2020年9月26日讯/生物谷BIOON/---今年3月，来自美国康涅狄格大学健康中心生物医学工程系的研究人员开始开发一种新的低成本的基于CRISPR的诊断方法，用于检测包括HIV病毒和新型冠状病毒（SARS-CoV-2）在内的传染病。如今，这种方法向成为快速检测传染病的尖端诊断技术又迈进了一步。在一项新的研究中，在康涅狄格大学健康中心生物医学工程系副教授C
2020年9月26日讯/生物谷BIOON/---今年3月，来自美国康涅狄格大学健康中心生物医学工程系的研究人员开始开发一种新的低成本的基于CRISPR的诊断方法，用于检测包括HIV病毒和新型冠状病毒（SARS-CoV-2）在内的传染病。如今，这种方法向成为快速检测传染病的前沿诊断技术又迈进了一步。
在一项新的研究中，在康涅狄格大学健康中心生物医学工程系副教授Changchun Liu博士的领导下，这些研究人员开发出的这种称为“All-In-One-Dual CRISPR-Cas12a（AIOD-CRISPR）”的方法简单地、快速地、超灵敏地可视化检测SARS-CoV-2，可在家庭或小诊所使用。相关研究结果于2020年9月18日发表在Nature Communications期刊上，论文标题为“Ultrasensitive and visual detection of SARS-CoV-2 using all-in-one dual CRISPR-Cas12a assay”。
这些研究人员利用COVID-19临床拭子样本验证了这种诊断方法的临床可行性。此外，他们还使用低成本的暖手宝作为孵育器，在20分钟内给出临床样本检测结果。
Liu说，“使用一次性暖手宝加热，可使得AIOD-CRISPR检测无需昂贵的电学设备，从而实现了对COVID-19的无仪器及时分子诊断（point of care molecular diagnostics）。”
核酸扩增测试（PCR/RT-PCR）是目前较早检测病原体的最敏感、最特异的方法，但是由于需要专门的实验室设备和训练有素的技术人员，不适合用于快速的及时诊断。然而，高传染性的病原体则需要实时监测，以便阻止它们在人与人之间的传播。
在这项新的研究中，Liu和他的研究团队使用28个临床COVID-19拭子样本的RNA提取物评估了他们的AIOD-CRISPR方法，其中包括8个COVID-19阳性样本。为了确保检测的可靠性，每个样本都在两个独立的实验中测试了两次。所有8个COVID-19阳性样本均在40分钟内确诊为阳性，而且是通过目视检测予以确认的。这些结果也与美国疾控中心（CDC）批准的RT-PCR方法的结果一致。
这些研究人员还使用低成本的暖手宝作为孵育器来检测患者样本，以消除对电孵育器的需求。AIOD-CRISPR试管被直接放置在一个气动的暖手宝上，在LED灯下用肉眼就可以看到检测结果。
Liu说，“这种简单、便携、灵敏的检测平台，有可能在家庭、医生办公室，甚至在免下车检测点，对COVID-19及其他传染病进行快速的较早诊断。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Xiong Ding et al. Ultrasensitive and visual detection of SARS-CoV-2 using all-in-one dual CRISPR-Cas12a assay. Nature Communications, 2020, doi:10.1038/s41467-020-18575-6.
2.Researchers validate clinical feasibility for CRISPR-based COVID-19 testing at point of care
https://phys.org/news/2020-09-validate-clinical-feasibility-crispr-based-covid-.html
在一项新的研究中，在康涅狄格大学健康中心生物医学工程系副教授Changchun Liu博士的领导下，这些研究人员开发出的这种称为“All-In-One-Dual CRISPR-Cas12a（AIOD-CRISPR）”的方法简单地、快速地、超灵敏地可视化检测SARS-CoV-2，可在家庭或小诊所使用。相关研究结果于2020年9月18日发表在Nature Communications期刊上，论文标题为“Ultrasensitive and visual detection of SARS-CoV-2 using all-in-one dual CRISPR-Cas12a assay”。
AIOD-CRISPR测试方法的设计与工作原理，图片来自Nature Communications, 2020, doi:10.1038/s41467-020-18575-6。
这些研究人员利用COVID-19临床拭子样本验证了这种诊断方法的临床可行性。此外，他们还使用低成本的暖手宝作为孵育器，在20分钟内给出临床样本检测结果。
Liu说，“使用一次性暖手宝加热，可使得AIOD-CRISPR检测无需昂贵的电学设备，从而实现了对COVID-19的无仪器及时分子诊断（point of care molecular diagnostics）。”
核酸扩增测试（PCR/RT-PCR）是目前较早检测病原体的最敏感、最特异的方法，但是由于需要专门的实验室设备和训练有素的技术人员，不适合用于快速的及时诊断。然而，高传染性的病原体则需要实时监测，以便阻止它们在人与人之间的传播。
在这项新的研究中，Liu和他的研究团队使用28个临床COVID-19拭子样本的RNA提取物评估了他们的AIOD-CRISPR方法，其中包括8个COVID-19阳性样本。为了确保检测的可靠性，每个样本都在两个独立的实验中测试了两次。所有8个COVID-19阳性样本均在40分钟内确诊为阳性，而且是通过目视检测予以确认的。这些结果也与美国疾控中心（CDC）批准的RT-PCR方法的结果一致。
这些研究人员还使用低成本的暖手宝作为孵育器来检测患者样本，以消除对电孵育器的需求。AIOD-CRISPR试管被直接放置在一个气动的暖手宝上，在LED灯下用肉眼就可以看到检测结果。
Liu说，“这种简单、便携、灵敏的检测平台，有可能在家庭、医生办公室，甚至在免下车检测点，对COVID-19及其他传染病进行快速的较早诊断。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Xiong Ding et al. Ultrasensitive and visual detection of SARS-CoV-2 using all-in-one dual CRISPR-Cas12a assay. Nature Communications, 2020, doi:10.1038/s41467-020-18575-6.
2.Researchers validate clinical feasibility for CRISPR-based COVID-19 testing at point of care
https://phys.org/news/2020-09-validate-clinical-feasibility-crispr-based-covid-.html
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