Sci Adv: 数学模型帮助筛选可用于治疗COVID19的药物
来源：本站原创 2020-08-17 21:51
最近一段时间内，研究人员和科学家一直在寻找多种治疗COVID-19的解决方案。
2020年8月17日讯/生物谷BIOON/---最近一段时间内，研究人员和科学家一直在寻找多种治疗COVID-19的解决方案。
在最近一项研究中，芝加哥大学普利兹克分子工程学院（PME）的研究人员使用了最先进的计算机模拟技术来识别可以快速解决这一全球流行病的现有药物。
他们的发现发表在8月14日的《Science Advance》杂志上。
2月初，由于大流行病的迅速发展，Juan de Pablo教授和他的学生利用他们的分子建模专业知识来帮助找到针对这种疾病的治疗方法。de Pablo解释说：“由于高通量筛选中考虑了大量的化合物，这些计算必须涉及许多简化，然后必须使用实验和更精细的计算来评估结果。”
研究人员首先专注于发现目标病毒的弱点。他们选择了其主要蛋白酶：Mpro。 Mpro是一种重要的冠状病毒酶分子，在病毒的生命周期中起着至关重要的作用。它促进了病毒转录其RNA并在宿主细胞内复制其基因组的能力。
Ebselen是一种有希望成为对抗Mpro武器的药物。 Ebselen是具有抗病毒，抗炎，抗氧化，杀菌和保护细胞特性的化合物。 Ebselen用于治疗多种疾病，包括双相情感障碍和听力下降。多项临床试验证明了其在人体中的安全性。
de Pablo和他的学生着手开发酶和药物的详细模型。通过使用这些模型和复杂的超级计算机模拟，他们发现小的Ebselen分子能够以两种不同方式降低Mpro的活性。
“除了在酶的催化位点结合外，Ebselen还与远处的位点牢固结合，后者依靠一种将信息从大分子的一个区域携带到另一区域的机制来干扰酶的催化功能。通过微妙的结构重组来摆脱它。”
这一发现特别重要，因为它有助于解释Ebselen作为再利用药物的潜在功效，并且揭示了该病毒的一个新漏洞，该漏洞以前不为人所知，可用于开发针对COVID-19的新治疗策略。
该研究小组发现了两个结合位点，有望使Ebselen成为设计和开发新型Mpro抑制剂和COVID-19治疗药物的新药。Pablo说：“蛋白酶是病毒中许多蛋白质的一种，我们正在系统地研究与病毒功能有关的其它蛋白质，并研究其脆弱性及其对多种药物的反应。”（生物谷 Bioon.com）
资讯出处：Preexisting drug shows promise in fight against COVID-19
原始出处： Molecular Characterization of Ebselen Binding Activity to SARS-CoV-2 Main Protease, Science Advances 14 Aug 2020: DOI: 10.1126/sciadv.abd0345 , advances.sciencemag.org/conten … 08/14/sciadv.abd0345
在最近一项研究中，芝加哥大学普利兹克分子工程学院（PME）的研究人员使用了最先进的计算机模拟技术来识别可以快速解决这一全球流行病的现有药物。
他们的发现发表在8月14日的《Science Advance》杂志上。
（图片来源：Www.pixabay.com）
2月初，由于大流行病的迅速发展，Juan de Pablo教授和他的学生利用他们的分子建模专业知识来帮助找到针对这种疾病的治疗方法。de Pablo解释说：“由于高通量筛选中考虑了大量的化合物，这些计算必须涉及许多简化，然后必须使用实验和更精细的计算来评估结果。”
研究人员首先专注于发现目标病毒的弱点。他们选择了其主要蛋白酶：Mpro。 Mpro是一种重要的冠状病毒酶分子，在病毒的生命周期中起着至关重要的作用。它促进了病毒转录其RNA并在宿主细胞内复制其基因组的能力。
Ebselen是一种有希望成为对抗Mpro武器的药物。 Ebselen是具有抗病毒，抗炎，抗氧化，杀菌和保护细胞特性的化合物。 Ebselen用于治疗多种疾病，包括双相情感障碍和听力下降。多项临床试验证明了其在人体中的安全性。
de Pablo和他的学生着手开发酶和药物的详细模型。通过使用这些模型和复杂的超级计算机模拟，他们发现小的Ebselen分子能够以两种不同方式降低Mpro的活性。
“除了在酶的催化位点结合外，Ebselen还与远处的位点牢固结合，后者依靠一种将信息从大分子的一个区域携带到另一区域的机制来干扰酶的催化功能。通过微妙的结构重组来摆脱它。”
这一发现特别重要，因为它有助于解释Ebselen作为再利用药物的潜在功效，并且揭示了该病毒的一个新漏洞，该漏洞以前不为人所知，可用于开发针对COVID-19的新治疗策略。
该研究小组发现了两个结合位点，有望使Ebselen成为设计和开发新型Mpro抑制剂和COVID-19治疗药物的新药。Pablo说：“蛋白酶是病毒中许多蛋白质的一种，我们正在系统地研究与病毒功能有关的其它蛋白质，并研究其脆弱性及其对多种药物的反应。”（生物谷 Bioon.com）
资讯出处：Preexisting drug shows promise in fight against COVID-19
原始出处： Molecular Characterization of Ebselen Binding Activity to SARS-CoV-2 Main Protease, Science Advances 14 Aug 2020: DOI: 10.1126/sciadv.abd0345 , advances.sciencemag.org/conten … 08/14/sciadv.abd0345
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