瓦解新型冠状病毒！如何追踪“敌人”关键的基因特性？
来源：本站原创 2020-03-29 21:29
2020年3月29日 讯 /生物谷BIOON/ --随着COVID-19疫情在全球范围内肆虐，来自蒙特利尔大学的生物信息学家如今开始使用人工智能手段来追踪引发这次大流行的冠状病毒的遗传图谱及特性，研究者Julie Hussin表示，自从SARS-CoV-19在中国出现以来，其已经发生了进化，因此我们需要深入了解它，以便能开发出个体化的疫苗和疗法策略。如今研究
2020年3月29日 讯 /生物谷BIOON/ --随着COVID-19疫情在全球范围内肆虐，来自蒙特利尔大学的生物信息学家如今开始使用人工智能手段来追踪引发这次大流行的冠状病毒的遗传图谱及特性，研究者Julie Hussin表示，自从SARS-CoV-19在中国出现以来，其已经发生了进化，因此我们需要深入了解它，以便能开发出个体化的疫苗和疗法策略。
如今研究人员发起了一项ColCorona研究来对6000名加拿大COVID-19患者进行相关的药物测试，他们想通过研究来追踪SARS-CoV-19的基因特性；研究者表示，病毒的遗传进化图谱就好像树一样，树干的基础是最原始的第一种病毒，其是从蝙蝠传染给人类的，然而会发生许多变异，从树干向上延伸到所有树枝，研究人员将会尝试利用收集自全球不同地区活病毒中的RNA来对病毒进行非常准确的描述和图谱绘制。
图片来源：CC0 Public Domain
研究者利用其在群体遗传学、统计遗传学和深度学习方面的专业知识，并与其它研究人员进行合作，最终他们将会在病毒不同的进化阶段来进行病毒遗传序列进行分析，同时他们将会靶向作用与地理区域相关的指标，在这些区域中，患者的COVID-19检测结果均为阳性。具体而言，研究者非常感兴趣的是可能影响人类的病毒毒株与人类宿主之间的相互作用，其或许会依赖于种族、性别、年龄、共患病、处方药及个人基因等信息，相关知识对于理解流行病学的进化以及设计新型治疗手段至关重要。
计算生物学
顾名思义，生物信息学旨在通过计算机计算的方式来解决生物学问题，由于病毒是一种活的有机体，生物信息学家相信他们能利用强大的计算机来缩小对病毒遗传组成和多种突变的研究，目前研究结果尚未公布，但在全球成千上万个专业的实验室中，这种病毒引起了很多科学家们极大的关注。
研究者Hussin的实验室首先开始检索关于COVID-19大量的文献报道，其中有400多项与SARS-CoV-19的病毒基因组相关，研究者解释道，很多中国研究团队专注于该病毒的研究，而且在非常短的时间里发表了他们的研究结果，这对于我们而言非常有用，但后期我们需要开展更为广泛的研究。
一种吸引人的病毒
由于其传播方式的效率，SARS-CoV-19让研究人员非常着迷，在短短几个月内，SARS-CoV-19已经传播到了多个国家，而且如今其还在全球继续扩散蔓延中，组成病毒DNA的大量碱基已经发生了突变，病毒会对自然选择产生响应，从而使得最适合的突变得以保留并继续传播，这就会使得病毒的传播更加有效。这一过程也正是研究人员研究的重点，目前研究人员正在通力合作来进行病毒进化及突变的相关研究，后期他们将会专注于研究与人类健康相关的病毒基因组进化相关的研究。（生物谷Bioon.com）
参考资料：
【1】Coronavirus: Tracking the enemy down—to its genes
by University of Montreal
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