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  • Cell:挑战常规!真核生物基因组周期性竟由突变导致

    2018年11月11日/生物谷BIOON/---自从21世纪初人类、小鼠和果蝇等生物的基因组序列为人所知以来,一些科学家们就已注意到由腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)组成的碱基对在基因组中的比例具有明显的周期性。事实上,在基因组中,每隔10个碱基对观察到A/T碱基对存在的几率就会增加。这种周期性与DNA缠绕核小体的方式有关。科学家们给出的解释是自然选择有利于A/T碱基的出现,这些因为这两种碱基为DNA

  • 北京基因组所开发系列特色科学数据库

    近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数

  • 基因组测序揭示蒙古族遗传结构

      基因测序技术让人类对基因多样性有了更深入的了解,然而从目前所收集到的蒙古族遗传资料来看,数量依然有限。为解决这一问题,内蒙古民族大学生命科学学院白海花及其团队等人对175名蒙古人进行全基因组测序,以揭示蒙古族的遗传结构,相关研究结果以《175名蒙古人的全基因组测序揭示特定种群的遗传结构》为题,于11月6日发表在《自然—遗传学》上。大约在1000年前,蒙古帝国扩张,蒙古族的统

  • Circ Res:重大进展!利用CRISPR/Cas9基因组编辑有望阻止心源性猝死

    2018年11月8日/生物谷BIOON/---每年,全世界至少有300万人死于心源性猝死(sudden cardiac death,也称心脏性猝死)。在美国,这个数字高达45万人。虽然心源性猝死在老年人中更为常见,但是年轻人也受到很大影响。在1~40岁的年龄组中,每年每10万人中就有9人受到影响。在这个年龄组中,遗传性心脏病,包括遗传性心律失常,导致相当大一部分的心源性猝死。在一项新的研究中,美国

  • 复旦大学Cell子刊发文揭示TET2如何联系表观遗传调控和基因组稳定性维持

    2018年11月7日 讯 /生物谷BIOON/ --本文亮点:SNIP1介导TET2和多个转录因子的相互作用,包括c-MYCTET2通过SNIP1依赖性方式保护细胞,避免发生DNA损伤诱导的细胞凋亡TET2-SNIP1-c-MYC调控轴帮助TET2实现DNA序列特异性招募DNA双加氧酶TET2能够通过催化5-甲基胞嘧啶发生去甲基化来进行基因表达的调控,通过表观遗传学的方式影响基因活动。但TET2本

  • 将测序150万物种,地球生物基因组计划启动

      11月1日,一项对全球所有复杂生物体基因组进行测序的雄心勃勃的计划在英国伦敦正式启动。“基因变异是所有遗传学知识的源泉。”项目成员之一、澳大利亚墨尔本拉筹伯大学进化遗传学家Jenny Graves说,“你拥有的基因变异越多就越好——那么为什么不对所有的事物展开测序呢?”这项地球生物基因组计划的目标便是在未来10年内对全世界约150万种已知的动物、植物、原生动物和真菌物种(统

  • 日本研究团队成功破译“绣球菌”基因组

    据日本共同社10月31日报道,日本九州产业大学和东京女子医科大学的联合研究团队30日在英国科学杂志网络版上发表成果称,成功破译自古就被用于中药、也被称为“神奇菌菇”的“绣球菌”基因组,确认其中含有与被视为有效抑制动脉硬化的女性荷尔蒙类似的成分。研究团队表示“希望有助于开发新的医药品和健康食品”。绣球菌是菌菇的一种,是非褶孔菌目、绣球菌科、绣球菌属。子实体中等至大形,肉质,由一个粗壮的柄上发出许多分

  • Science子刊:发现一种新的Cas9能够靶向基因组中将近一半的位点

    2018年10月28日/生物谷BIOON/---基因组编辑系统CRISPR-Cas9已成为医学研究中的一种非常重要的工具,并且最终可能在农业、生物能源和食品安全等领域产生重大影响。CRISPR-Cas9可通过短的RNA片段(即向导RNA, gRNA)引导到基因组上的不同位点,在那里,一种称为Cas9的DNA切割酶随后进行所需的编辑。然而,尽管这种基因编辑工具取得了相当大的成功,但是它在基因组上能够

  • CRISPR新工具开辟更多可编辑基因组位点

      据最新一期《科学进展》报道,美国麻省理工学院(MIT)研究人员发现了一种可靶向几乎一半基因组位点的Cas9酶,从而极大地扩展了基因编辑工具的适用范围。尽管基因编辑工具近年来取得了相当大的成功,但CRISPR-Cas9在基因组上可访问的位点数量仍然有限。这是因为CRISPR需要在基因组靶向位点侧翼的一段特定序列——原型间隔区相邻基序(PAM)来识别该位点。最广泛使用的Cas9

  • 研究人员建立植物基因组高效C-T单碱基编辑新系统

     单碱基编辑技术(Base editor)是基于CRISPR系统的新型靶基因定点修饰技术,在不产生DNA双链断裂的情况下,利用胞嘧啶脱氨酶或人工进化的腺嘌呤脱氨酶对靶位点进行精准的单碱基编辑,从而实现C-T或A-G的替换。目前,基于融合大鼠胞嘧啶脱氨酶APOBEC1的BE3介导的C-T碱基编辑技术已广泛应用在植物中,但该系统仍然存在一定的缺陷,如编辑效率低、编辑的活性窗口相对狭窄以及对G