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  • 基因组算法立功!发现膀胱癌新靶点

      膀胱癌是美国第六常见的癌症,根据美国癌症学会(ACS)的统计,2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌,将近17000人死于这种疾病。在过去几年中,逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌(p53-like bladder cancer)的基因表达模式与侵袭性的肌肉浸润性疾病相关,但人们尚不清楚该亚型对患者预后有何影响。现在,纽约西奈

  • 小麦等大基因组作物核心基因组低成本组装及新基因挖掘研究获进展

    6月21日,Nucleic Acids Research 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与中科院遗传与发育生物学研究所童依平研究组合作完成的题为CGT-seq: epigenome-guided de novo assembly of the core genome for divergent populations with large genom

  • 两项研究表明利用CRISPR-Cas9基因组编辑有望治疗α-1抗胰蛋白酶缺乏症

    2018年7月5日/生物谷BIOON/---在两项开创性的概念验证研究中,两个研究团队利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术校正导致α-1抗胰蛋白酶(alpha-1 antitrypsin, AAT)缺乏症的基因突变,成功地在α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)模式小鼠的肝脏中进行靶向基因校正,将低水平的正常AAT恢复到正常水平。图片来自iStock/Meletios Verras。在第一项研究中

  • 综述 | 基于二代测序对癌症基因组异质性的研究推动癌症的精准治疗

    小编推荐会议:耶鲁大学遗传系张嘉玲博士(Jialing Zhang)和南方医科大学教授、耶鲁大学顾问潘星华博士(Xinghua Pan)等在PCM第一期发表综述:基于二代测序对癌症基因组异质性的研究推动癌症的精准治疗(Characterization of cancer genomic heterogeneity by next-generation sequencing advances pre

  • 科学家给2万年前大熊猫做线粒体基因组测序

    18日出版的《当代生物学》介绍了一项由中科院古脊椎所研究员付巧妹及团队主导、中科院动物所研究员魏辅文参与的研究成果。他们提取、捕获和测序了一个2.2万年前的大熊猫完整的线粒体基因组。这意味着获取大熊猫的古核DNA指日可待。由于现存大熊猫种群的减少,其基因重建可能无法准确描述这一物种的进化历史,科学家一直在寻找从古代大熊猫化石提取到线粒体基因组或核基因组的方法。2014年,付巧妹团队成员张颖奇等人在

  • 乙肝病毒基因组嵌入人类基因与癌变相关

    日本理化学研究所和广岛大学近日宣布,他们的联合研究小组对肝脏感染乙型肝炎病毒(HBV)进行基因组分析,发现了乙肝病毒嵌入人类基因组的机制和病毒致癌的部分机制。全世界约3.5亿人感染乙肝病毒,每年约88万人因乙肝病毒死亡。乙肝病毒感染治疗手段有限,主要使用干扰素和核酸模拟制剂,不但需要长期服药,还存在副作用和病毒耐药性等问题;而且治疗效果并不理想,多数患者仍然会从乙肝病毒感染转向慢性肝炎和肝癌。一般

  • 研究建立拉曼介导靶向元基因组技术研究海洋固碳机制

     海洋覆盖地球表面的71%,是地球上最大的活跃碳库。海洋微生物个体虽小,但数量极大,每年固定二氧化碳达22亿吨,占地球上年生物固碳总量的一半以上。然而,海洋微生物的原位功能通常难以直接测量而且绝大多数尚未培养。因此,如何直接建立细胞原位功能与基因组的关联一直是业界的关键方法学挑战。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心建立了拉曼介导的靶向元基因组技术(Ramanome-Gui

  • 柳叶刀·血液学:基因组测序降低输血风险 如何做到的?

      《柳叶刀 血液学》近日发布了一条论文消息,哈佛医学院和纽约血液中心的科学家们,成功开发出基于全基因组测序的血型分型全新算法——bloodTyper。对照耗时费力的传统测定方法,例如血清学测定法或单核苷酸多态性(SNP)测定法,bloodTyper血型分型的准确度超过90%,且可供在线使用,这将有利于输血前的血型配型,促进安全输血。大多数人都很熟悉 ABO血型、或Rh血型分型

  • 我国科学家完成小麦A基因组测序和精细图谱绘制

      小麦是全球最重要的粮食作物,养活了世界上40%的人口,提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国,常年种植面积为2,400万公顷左右,年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成的异源六倍体,含有A、B和D三个亚基因组,其基因组大(约17 Gb,是水稻基因组的40倍)而复杂,85%以上基因组DNA为重复序列,致使基因组测序研

  • Nat Med:警惕!基因组的特殊突变或会让你更容易患上阿尔兹海默病

    2018年5月17日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中,来自Bellvitge医学研究所(IDIBELL)的科学家们通过研究发现,DNA微小改变的遗传或会改变基因PM20D1的表达,同时这还与个体阿尔兹海默病患病风险增加直接相关。图片来源:IDIBELL 研究者Johannes Graff说道,在过去7年里,我们对阿尔兹海默病和其它