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  • 单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

      日前,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺腺癌提供了新的临床标志物。据悉,该研究由北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北

  • 烈小冰凭借单细胞测序C位出道,你pick了吗?

    烈小冰经过多年废寝忘食的练习,这个夏天,携BD Rhapsody单细胞分选系统在单细胞测序界出道啦! 说到单细胞测序这个网红,一直以来都以"三高"著名--高逼格、高门槛、高分文章。那么,它究竟有哪些障碍让众多研究者无法跨越呢?首先,来简单科普一下什么是单细胞测序(Single Cell Sequencing)。常规的高通量测序是多细胞批量测序(Bulk Sequencing),所提取的R

  • 免疫学单细胞研究新技术

              小编推荐:您不可错过的2018单细胞组学技术与应用研讨会人体的免疫系统是一个非常庞大,而且非常分散、各自为政(decentralized)的守卫大军。尽管有数十亿分工明确的免疫细胞不停地守护着人体的安全,但是我们很难明确指出,在某个时刻、某个地方,哪个免疫细胞在执行什么任务。随着蛋白质组学技术和基因组学技术的发展,科研人员也在不

  • 独家专访中国学者《Nature》子刊发布最大规模肺癌T细胞单细胞免疫图谱

           小编推荐:您不可错过的2018单细胞组学技术与应用研讨会2018年6月26日凌晨1:00,《Nature Medicine》发表迄今针对肿瘤相关T细胞的规模最大的单细胞组学研究,北大张泽民教授团队通过非小细胞肺癌12,346个T细胞的单细胞测序及分析,发现了可能的肺癌新靶点。图1:  肿瘤免疫细胞单细胞测序流程图,图片来自《Natur

  • Genome Res:科学家开发出能对单细胞进行大规模分析的新型工具—BigSCale

    2018年6月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中,来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平,这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理,这项研究中,研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库,这或能极大地扩展单细胞基因组学的研究范围。图片来源:xoomtr

  • 《Cell》:单细胞组蛋白修饰模型展示表观遗传多样性随着衰老而增加

    染色质修饰包括组蛋白转录后修饰,组蛋白多样性。连同DNA一起调控表观遗传表型。虽然染色质修饰在多种生理学过程和人类疾病中都有重要的意义,但是由于此前存在的技术检测通道有限,无法同时检测各种免疫细胞亚群特异性marker和各种染色质修饰。因此在人类免疫细胞中进行染色质研究具有挑战性。近期出现的一个技术突破——质谱流式技术,可以在少量细胞甚至是单细胞中进行四十种以上参数采集,可以完美应对这一挑战。斯坦

  • Science:大量肾脏单细胞的RNA测序分析阐明慢性肾脏疾病的发病根源

    2018年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --肾脏是一个非常复杂的器官,其功能远远不止一个简单的“过滤器”,肾脏要正常发挥功能,需要多个高度特异性的不同细胞类型之间相互作用来帮助机体通过尿液排出废物、平衡体液,调节血压并且分泌多种激素。图片来源:Katalin Susztak, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania近日一

  • Nat Biotechnol:新型算法或能在单细胞分辨率下对多种数据进行有效整合

    2018年4月4日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自纽约大学的研究人员通过研究开发出了一种新型算法,其能在单细胞分辨率下多多种测序数据集进行排列,这种新方法未来或有望用来帮助理解不同群体的细胞如何在疾病进展过程中发生改变以及如何对药物疗法产生反应。图片来源:www.phys.org研究者Rahul Satija说道,

  • Science重大突破!单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!

    2018年3月19日讯 /生物谷BIOON /——来自艾伦学院和华盛顿大学的科学家们开发出了一种廉价的高级技术可以检测成百上千个细胞的基因表达。这项基于配位的转录组测序技术(Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing,SPLiT-seq)是一项可延展的用于表征单个细胞RNA水平的技术,可用于鉴定脑部疾病及其他组织中的不同细胞类型,这项研究于

  • Nature:研究绘制出人脑前额叶发育的单细胞图谱

    近日,中国科学院生物物理研究所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作,绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱,并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究,为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果以Single-cell RNA-Seq surveys a developmental lands