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融资5700万美元,张锋新公司推出多重表观基因编辑平台,可同时7次表观基因编辑

来源:生物世界 2024-05-08 09:32

众所周知,表观遗传学是基因组的“软件”,通过改变基因的可及性而不改变DNA序列来调控基因表达。DNA甲基化和组蛋白修饰共同作用,打开或关闭基因,从而决定基因的表达水平。

2024年1月,CRISPR基因编辑先驱张锋与基因测序公司Illumina前高管Alex Aravanis、癌症早筛公司GRAIL前高管Arash Jamshidi等人联合创立了一家名为 Moonwalk Biosciences 的生物科技初创公司,并宣布完成了5700万美元的种子轮和A轮融资。

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Moonwalk 公司在其官网介绍道,它是第一家将表观遗传发现平台与精确基因工程相结合的公司,利用最先进的表观遗传靶点人工智能预测技术以及最广泛的表观遗传工程工具,在表观基因组水平重编程细胞以恢复其健康状态,从根本上为药物的发现和开发开辟新途径。

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Moonwalk的创始人

近日,在美国基因与细胞治疗年会(ASGCT)上,Moonwalk 公司CEO兼联合创始人 Alex Aravanis 分享了该公司的多重表观遗传工程平台,重点介绍了高分辨率单细胞甲基化图谱和靶向甲基化的表观基因编辑。

Alex Aravanis 首先介绍了其多重表观遗传工程平台的两个关键技术——EpiRead™和

EpiWrite™。

众所周知,表观遗传学是基因组的“软件”,通过改变基因的可及性而不改变DNA序列来调控基因表达。DNA甲基化和组蛋白修饰共同作用,打开或关闭基因,从而决定基因的表达水平。

表观阅读

EpiRead™,即“表观阅读”,Alex Aravanis 作为Illumina公司的前首席技术官、高级副总裁以及研究和产品开发负责人,领导推出了基于基因组学的研究和临床应用的下一代测序行业领先产品,包括全基因组测序、癌症的全面基因组分析、COVID-Seq以及用于解读基因组信息的前沿AI工具。他在“阅读”基因组领域可谓经验丰富,他表示,Moonwalk将展示T细胞表观遗传图谱和特定的甲基化图谱数据,这是“第一个主要T细胞亚群的完整甲基化图谱”。

他进一步解释道,Moonwalk对人类的甲基化组具有非凡的阅读和理解能力,并预测哪些位点需要修改,包括已知靶点和发现新靶点,我们现在真正“打开了”甲基化组,观察其所有细节,从而找到哪些位点可以进行修饰并改变表型。

EpiRead™技术首次实现在单细胞分辨率下对基因组中全部2800万个CpG位点的甲基化图谱进行建模和绘制,并已经用于创建T细胞亚群和脂肪细胞的首个全面的表观遗传学轮廓,从而能够更深入地了解细胞状态与疾病之间的生物学和基因调控机制,更好地指导已知靶点的疗法开发,并且在Moonwalk专有的机器学习/人工智能算法的帮助下,还能够实现复杂疾病的新靶点发现。

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表观书写

Alex Aravanis 还介绍了其表观基因编辑技术EpiWrite™,该技术可对人类原代细胞同时进行多达7次的多重表观基因编辑,能够在85%以上的细胞成功进行7次成功编辑,这是表观遗传工程领域的一个新突破。

EpiWrite™利用EpiRead™获得的信息,可同时抑制或激活多个基因的活性,从而实现多重表观基因编辑,更重要的是,这种表观基因编辑不涉及对DNA的切割,并且在本质上是可逆的,效果可以持久也可以短暂,相比基于CRISPR的基因编辑技术,表观基因编辑避免了修改DNA的潜在基因组毒性。此外,EpiWrite™系统可以通过LNP、AAV或其他递送载体递送至靶组织/细胞。

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Alex Aravanis 进一步表示,使用基因编辑技术对DNA进行编辑时,不可避免的会引入插入、删除和易位等问题。而Moonwalk的表观基因编辑并未破坏DNA,且可实现多重编辑,对于CAR-T等复杂的细胞疗法,有时需要同时进行三到四个基因修饰,使用传统CRISPR基因编辑时需要反复编辑和细胞扩增,这可能造成基因毒性。此时多重表观基因编辑的优势就体现出来了,实际上,Moonwalk的这些技术已经引起了许多制药公司的兴趣。

表观阅读+表观书写

EpiWrite™利用EpiRead™的联合应用,使Moonwalk可以通过描述感兴趣基因的表观遗传特征、优化导向设计、进行多重基因抑制和激活,以及确认表观遗传调控的特异性来实现表观基因组工程,从而使开发新型表观遗传药物成为可能。

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除了上述DNA甲基化之外,Moonwalk还在开发其他表观遗传修饰的技术,例如针对组蛋白的修饰,这对于激活那些可能具有组织特异性表达或因年龄或疾病而受到抑制的内源性基因尤其重要。目前还没有很好的方法能以持久且安全的方式激活内源性基因表达,而表观遗传工程在这方面具有很大的潜力。

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