Viruses：揭示SARS-CoV-2病毒蛋白存在进化上保守的功能区域
来源：本站原创 2020-04-19 17:57
2020年4月19日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2（之前称为2019-nCoV）导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。在构建出新型冠状病毒SARS-CoV-2的三维结构路线图并与全球科学界分享两个月后，美国伍斯特理工学院生物信息学研究员Dmitry Korkin及其同事们在Viruses期刊上发表一篇标
2020年4月19日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2（之前称为2019-nCoV）导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。在构建出新型冠状病毒SARS-CoV-2的三维结构路线图并与全球科学界分享两个月后，美国伍斯特理工学院生物信息学研究员Dmitry Korkin及其同事们在Viruses期刊上发表一篇标题为“Structural Genomics of SARS-CoV-2 Indicates Evolutionary Conserved Functional Regions of Viral Proteins”的论文。
在这篇论文中，Korkin及其团队描述了他们如何使用生物信息学和分子建模来重建SARS-CoV-2的主要病毒蛋白的三维结构及其与人蛋白的相互作用。
具体来说，Korkin团队发现了3种严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒（SARS-CoV）分离株。SARS-CoV是2003年发现的一种冠状病毒，也引起了全世界的感染，并造成大量死亡。
Korkin团队得出了三个初步结论，这些结论可能在病毒建模和帮助科学家进行未来的药物发现中起作用。首先，他们确定与人类SARS-CoV和其他相关动物病毒相比，构成SARS-CoV-2的蛋白发生的变化不是均匀分布的，而是经常在蛋白表面上聚集性出现。
其次，Korkin团队发现“刺突蛋白”（SARS-CoV-2表面上的一种可以被人抗体靶向的蛋白）区域与SARS-CoV中的同一区域非常不同，这表明现有的SARS疫苗可能并不有效，人们需要一种新疫苗。
与此同时，Korkin团队得出的第三个结论是，先前开发的抗SARS-CoV病毒候选药物靶向的区域非常完整，这表明对这些药物进行重新利用是可能的。
Korkin在这篇论文中写道，“这项计算研究工作的目标是双重的。”他说，他想“...让这种结构路线图和相关发现对研究界完全可用”，并且“...帮助科学家们破译与SARS-CoV-2感染、疫苗开发和抗病毒药物发现有关的分子机制。”
今年2月，Korkin和他的团队构建出并公布了SARS-CoV-2的三维结构路线图。当时，Korkin与世界各地的科学家们分享了这种路线图，以推动对COVID-19的更多研究。为了将研究结果快速分享给研究界，Korkin的完整三维结构路线图数据集和手稿预印本已于2月14日发布在bioRxiv上（bioRxiv, doi:10.1101/2020.02.10.942136）。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Suhas Srinivasan et al, Structural Genomics of SARS-CoV-2 Indicates Evolutionary Conserved Functional Regions of Viral Proteins. Viruses, Published: 25 March 2020, doi:10.3390/v12040360.
2.WPI Researcher’s Paper on COVID-19 Published in Viruses Journal
https://www.wpi.edu/news/wpi-researcher-s-paper-covid-19-published-viruses-journal
图片来自Viruses, doi:10.3390/v12040360。
在这篇论文中，Korkin及其团队描述了他们如何使用生物信息学和分子建模来重建SARS-CoV-2的主要病毒蛋白的三维结构及其与人蛋白的相互作用。
具体来说，Korkin团队发现了3种严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒（SARS-CoV）分离株。SARS-CoV是2003年发现的一种冠状病毒，也引起了全世界的感染，并造成大量死亡。
Korkin团队得出了三个初步结论，这些结论可能在病毒建模和帮助科学家进行未来的药物发现中起作用。首先，他们确定与人类SARS-CoV和其他相关动物病毒相比，构成SARS-CoV-2的蛋白发生的变化不是均匀分布的，而是经常在蛋白表面上聚集性出现。
其次，Korkin团队发现“刺突蛋白”（SARS-CoV-2表面上的一种可以被人抗体靶向的蛋白）区域与SARS-CoV中的同一区域非常不同，这表明现有的SARS疫苗可能并不有效，人们需要一种新疫苗。
与此同时，Korkin团队得出的第三个结论是，先前开发的抗SARS-CoV病毒候选药物靶向的区域非常完整，这表明对这些药物进行重新利用是可能的。
Korkin在这篇论文中写道，“这项计算研究工作的目标是双重的。”他说，他想“...让这种结构路线图和相关发现对研究界完全可用”，并且“...帮助科学家们破译与SARS-CoV-2感染、疫苗开发和抗病毒药物发现有关的分子机制。”
今年2月，Korkin和他的团队构建出并公布了SARS-CoV-2的三维结构路线图。当时，Korkin与世界各地的科学家们分享了这种路线图，以推动对COVID-19的更多研究。为了将研究结果快速分享给研究界，Korkin的完整三维结构路线图数据集和手稿预印本已于2月14日发布在bioRxiv上（bioRxiv, doi:10.1101/2020.02.10.942136）。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Suhas Srinivasan et al, Structural Genomics of SARS-CoV-2 Indicates Evolutionary Conserved Functional Regions of Viral Proteins. Viruses, Published: 25 March 2020, doi:10.3390/v12040360.
2.WPI Researcher’s Paper on COVID-19 Published in Viruses Journal
https://www.wpi.edu/news/wpi-researcher-s-paper-covid-19-published-viruses-journal
版权声明 本网站所有注明“来源：生物谷”或“来源：bioon”的文字、图片和音视频资料，版权均属于生物谷网站所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将追究法律责任。取得书面授权转载时，须注明“来源：生物谷”。其它来源的文章系转载文章，本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的，转载内容不代表本站立场。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
87%用户都在用生物谷APP 随时阅读、评论、分享交流 请扫描二维码下载->
