Nat Methods：新技术能够准确指征肠道微生物的起源
来源：本站原创 2019-06-13 04:44
2019年6月13日 讯 /生物谷BIOON/ --加州大学洛杉矶分校领导的研究团队已经开发出一种更快，更准确的方法来确定人体中许多细菌的来源。从广义上讲，该工具可以推断出任何微生物组的起源。与需要数天或数周的工具相比，新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量遗传信息。该软件程序可用于医疗保健，公共卫生，环境研究和农业。该研究在线发表在《Nature Methods》上。微生物组通常
2019年6月13日 讯 /生物谷BIOON/ --加州大学洛杉矶分校领导的研究团队已经开发出一种更快，更准确的方法来确定人体中许多细菌的来源。从广义上讲，该工具可以推断出任何微生物组的起源。
与需要数天或数周的工具相比，新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量遗传信息。该软件程序可用于医疗保健，公共卫生，环境研究和农业。该研究在线发表在《Nature Methods》上。
微生物组通常包含数百至数千种微生物物种。人类的消化道、湖泊和河流，到处都可以找到微生物的存在。了解这些生物来自何处以及这些群落如何形成可以让科学家更详细地了解影响人类健康的微观生态过程。对此，研究人员开发了新型程序，为医生和科学家提供了一种更有效的工具来研究微生物的组成。
有了这些信息，医生将能够通过简单地分析他们的微生物组来区分健康人和患有特定疾病的人。科学家可以使用该工具检测水资源或食品供应链中的污染。
“微生物组已经与人体生理学和健康的许多方面联系在一起，但我们正处于了解微生物组的临床意义的早期阶段，”作者说道：“微生物组数据得到了前所未有的扩展，这使我们对微生物生命的各种功能和分布的了解迅速增加，尽管如此，如此庞大而复杂的数据集却带来了统计和计算方面的难题。”
研究人员表示，与其他源跟踪工具相比，FEAST的速度提高了300倍，并且更准确。此外，目前的工具只能分析较小的数据集，或仅针对被认为是有害污染物的特定微生物。研究人员说，这种新工具可以处理更大的数据集，并提供更完整的微生物信息以及来源。（生物谷Bioon.com）
资讯出处：New tool can pinpoint origins of the gut's bacteria
原始出处：Liat Shenhav, Mike Thompson, Tyler A. Joseph, Leah Briscoe, Ori Furman, David Bogumil, Itzhak Mizrahi, Itsik Pe’er, Eran Halperin. FEAST: fast expectation-maximization for microbial source tracking. Nature Methods, 2019; DOI: 10.1038/s41592-019-0431-x
与需要数天或数周的工具相比，新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量遗传信息。该软件程序可用于医疗保健，公共卫生，环境研究和农业。该研究在线发表在《Nature Methods》上。
微生物组通常包含数百至数千种微生物物种。人类的消化道、湖泊和河流，到处都可以找到微生物的存在。了解这些生物来自何处以及这些群落如何形成可以让科学家更详细地了解影响人类健康的微观生态过程。对此，研究人员开发了新型程序，为医生和科学家提供了一种更有效的工具来研究微生物的组成。
（图片来源：Www.pixabay.com）
有了这些信息，医生将能够通过简单地分析他们的微生物组来区分健康人和患有特定疾病的人。科学家可以使用该工具检测水资源或食品供应链中的污染。
“微生物组已经与人体生理学和健康的许多方面联系在一起，但我们正处于了解微生物组的临床意义的早期阶段，”作者说道：“微生物组数据得到了前所未有的扩展，这使我们对微生物生命的各种功能和分布的了解迅速增加，尽管如此，如此庞大而复杂的数据集却带来了统计和计算方面的难题。”
研究人员表示，与其他源跟踪工具相比，FEAST的速度提高了300倍，并且更准确。此外，目前的工具只能分析较小的数据集，或仅针对被认为是有害污染物的特定微生物。研究人员说，这种新工具可以处理更大的数据集，并提供更完整的微生物信息以及来源。（生物谷Bioon.com）
资讯出处：New tool can pinpoint origins of the gut's bacteria
原始出处：Liat Shenhav, Mike Thompson, Tyler A. Joseph, Leah Briscoe, Ori Furman, David Bogumil, Itzhak Mizrahi, Itsik Pe’er, Eran Halperin. FEAST: fast expectation-maximization for microbial source tracking. Nature Methods, 2019; DOI: 10.1038/s41592-019-0431-x
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