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Nature子刊:深圳大学张学记/刘翼振/陈勇团队开发基于Cas13a的新型DNA检测技术

来源:生物世界 2025-06-22 09:58

LbuCas13a 能够直接靶向 DNA 并具有强大的反式切割活性,研究团队在此基础上推出了名为 SUREST 的新型分子诊断技术平台,能够实现高灵敏度的 DNA 突变检测,代表了实时核酸测技术的进步

Cas13a 是由张锋教授发现的一种 VI 型 CRISPR-Cas 效应蛋白,被认为是一种 RNA 特异性核酸酶,具有 RNA 介导的 RNA 切割活性,。此外,它还具有依赖于靶标单链 RNA 的反式切割活性,因此,张锋将 Cas13a 用于病毒检测,实现了对 RNA 病毒的高灵敏度、高特异性、快速检测。

2025 年 6 月 20 日,深圳大学化学与环境工程学院张学记教授、刘翼振副教授、陈勇副研究员等在 Nature 子刊 Nature Biomedical Engineering 上发表了题为:LbuCas13a directly targets DNA and elicits strong trans-cleavage activity 的研究论文。

该研究发现,LbuCas13a 能够直接靶向 DNA 并具有强大的反式切割活性,研究团队在此基础上推出了名为 SUREST 的新型分子诊断技术平台,能够实现高灵敏度的 DNA 突变检测,代表了实时核酸检测技术新的进步。

在这项最新研究中,研究团队发现,来自口腔纤毛菌(Leptotrichia buccalis)的Cas13a(LbuCas13a)具有直接靶向 DNA 的能力,不受前间隔区侧翼序列(PFS)和前间隔区相邻基序序列(PAM)的限制,并且具有强大的反式切割(trans-cleavage)活性。与传统认知相反,LbuCas13a 并不降解 DNA 靶标。

这项研究揭示了 LbuCas13a 对 DNA 的单核苷酸特异性相较于 RNA 有所增强。这种特异性的增强归因于 CRISPR RNA(crRNA)对 DNA 的亲和力较低,从而提高了 crRNA 与 DNA 结合的能量障碍。

在上述发现的基础上,研究团队推出了基于 LbuCas13a 的卓越通用快速增强特异性检测技术(简称为 SUREST),作为一种新型分子诊断技术平台,SUREST 能够检测低至 0.3 阿摩尔的 CYP2C19(rs4986893)DNA 浓度。该基因编码的酶参与多种药物代谢,其活性受基因多态性影响,因此常被用于评估个体对特定药物的代谢能力差异,以指导精准用药、帮助制定个性化治疗方案。

研究团队还将 SUREST 应用于人类基因分型场景,结果表明,SUREST 在广泛的突变和序列背景下均表现出色。

总的来说,SUREST 代表了实时核酸检测技术新的进步,使其成为临床诊断中病原体识别和基因突变分析的有用工具。

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