J Proteome Res：穿山甲最可能是让SARS-CoV-2从蝙蝠跳跃到人类的中间宿主
来源：本站原创 2020-03-27 22:00
2020年3月27日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2（之前称为2019-nCoV）导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。随着科学家们争相了解更多关于SARS-CoV-2冠状病毒的信息，近期针对这种病毒基因组的两项研究得出了有争议的结论：蛇是这种新型病毒的中间宿主；一种重要的冠状病毒蛋白与一种HIV-1蛋白
2020年3月27日讯/生物谷BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2（之前称为2019-nCoV）导致2019年冠状病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。随着科学家们争相了解更多关于SARS-CoV-2的信息，近期针对这种病毒基因组的两项研究得出了有争议的结论：蛇是这种新型冠状病毒的中间宿主；一种重要的冠状病毒蛋白与一种HIV-1蛋白具有“不可思议的相似性”。
如今，在一项新的研究中，来自美国密歇根大学的研究人员驳斥了这两种观点，并提出像食蚁兽一样有鳞的穿山甲是蝙蝠和人类之间传播SARS-CoV-2的缺失环节。相关研究结果于2020年3月22日在线发表在Journal of Proteome Research期刊上，论文标题为“Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1”。
了解SARS-CoV-2来自何处以及它如何传播对于它的控制和治疗非常重要。大多数专家都同意，蝙蝠是SARS-CoV-2的天然宿主，但需要中间宿主才能让它从蝙蝠跳跃到人类。最近的一项分析这种新型冠状病毒基因组的研究提示着蛇是中间宿主，尽管事实上已知冠状病毒只感染哺乳动物和鸟类（Journal of Medical Virology, 2020, doi:10.1002/jmv.25682）。与此同时，一项不相关的研究比较了这种新型冠状病毒与HIV-1的刺突蛋白---一种负责让病毒进入哺乳动物细胞的关键蛋白---的序列，并指出了出乎意料的相似性（bioRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.01.30.927871）。尽管在遭受科学批评后，这篇发表在预印本服务器bioRxiv的论文被撤回，但是这引发了谣言和阴谋论，认为这种新型冠状病毒可能是在实验室里设计出来的。Yang Zhang及其同事们想要对SARS-CoV-2的DNA和蛋白序列进行更仔细和完整的分析，以解决这些问题。
与这两项之前的研究相比，这些研究人员使用了更大的数据集和更新更准确的生物信息学方法和数据库来分析SARS-CoV-2基因组。他们发现，与声称SARS-CoV-2和HIV-1之间独特地共享刺突蛋白的4个区域的说法不同的是，这4个序列片段可以在其他病毒（包括蝙蝠冠状病毒）中发现。在发现提示着蛇是中间宿主的分析中的错误后，他们从穿山甲组织中分离出DNA和蛋白序列，并寻找与SARS-CoV-2类似的序列。
这些研究人员在患病穿山甲的肺部中鉴定出与这种人类冠状病毒的蛋白存在91%序列一致性的蛋白。此外，来自穿山甲冠状病毒的刺突蛋白的受体结合结构域与SARS-CoV-2仅有5个氨基酸差异，相比之下，SARS-CoV-2的这种受体结合结构域和蝙蝠冠状病毒有19个氨基酸差异。这些研究人员说，这一证据表明穿山甲最可能是这种新型冠状病毒的中间宿主，但其他的中间宿主也是可能存在的。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Chengxin Zhang et al. Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1. Journal of Proteome Research, 2020, doi:10.1021/acs.jproteome.0c00129.
2.Missing link in coronavirus jump from bats to humans could be pangolins, not snakes
https://medicalxpress.com/news/2020-03-link-coronavirus-humans-pangolins-snakes.html
如今，在一项新的研究中，来自美国密歇根大学的研究人员驳斥了这两种观点，并提出像食蚁兽一样有鳞的穿山甲是蝙蝠和人类之间传播SARS-CoV-2的缺失环节。相关研究结果于2020年3月22日在线发表在Journal of Proteome Research期刊上，论文标题为“Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1”。
图片来自Journal of Proteome Research, 2020, doi:10.1021/acs.jproteome.0c00129。
了解SARS-CoV-2来自何处以及它如何传播对于它的控制和治疗非常重要。大多数专家都同意，蝙蝠是SARS-CoV-2的天然宿主，但需要中间宿主才能让它从蝙蝠跳跃到人类。最近的一项分析这种新型冠状病毒基因组的研究提示着蛇是中间宿主，尽管事实上已知冠状病毒只感染哺乳动物和鸟类（Journal of Medical Virology, 2020, doi:10.1002/jmv.25682）。与此同时，一项不相关的研究比较了这种新型冠状病毒与HIV-1的刺突蛋白---一种负责让病毒进入哺乳动物细胞的关键蛋白---的序列，并指出了出乎意料的相似性（bioRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.01.30.927871）。尽管在遭受科学批评后，这篇发表在预印本服务器bioRxiv的论文被撤回，但是这引发了谣言和阴谋论，认为这种新型冠状病毒可能是在实验室里设计出来的。Yang Zhang及其同事们想要对SARS-CoV-2的DNA和蛋白序列进行更仔细和完整的分析，以解决这些问题。
与这两项之前的研究相比，这些研究人员使用了更大的数据集和更新更准确的生物信息学方法和数据库来分析SARS-CoV-2基因组。他们发现，与声称SARS-CoV-2和HIV-1之间独特地共享刺突蛋白的4个区域的说法不同的是，这4个序列片段可以在其他病毒（包括蝙蝠冠状病毒）中发现。在发现提示着蛇是中间宿主的分析中的错误后，他们从穿山甲组织中分离出DNA和蛋白序列，并寻找与SARS-CoV-2类似的序列。
这些研究人员在患病穿山甲的肺部中鉴定出与这种人类冠状病毒的蛋白存在91%序列一致性的蛋白。此外，来自穿山甲冠状病毒的刺突蛋白的受体结合结构域与SARS-CoV-2仅有5个氨基酸差异，相比之下，SARS-CoV-2的这种受体结合结构域和蝙蝠冠状病毒有19个氨基酸差异。这些研究人员说，这一证据表明穿山甲最可能是这种新型冠状病毒的中间宿主，但其他的中间宿主也是可能存在的。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Chengxin Zhang et al. Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1. Journal of Proteome Research, 2020, doi:10.1021/acs.jproteome.0c00129.
2.Missing link in coronavirus jump from bats to humans could be pangolins, not snakes
https://medicalxpress.com/news/2020-03-link-coronavirus-humans-pangolins-snakes.html
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