研究人员开发m6Am修饰检测的新技术

北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心伊成器课题组在Nature Communications杂志发表了题为“m6Am-seq reveals the dynamic m6Am methylation in the human transcriptome”的文章，开发了mRNA上m6Am修饰检测的新技术，绘制了全转录组N6,2'-O-二甲基腺苷（m6Am）的修饰图谱。

动态可逆的RNA修饰在基因表达调控中扮演了至关重要的角色。N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物mRNA上最丰富的内部修饰，已经被证明参与调控RNA的代谢、翻译、选择性剪接和稳定性等多种生物学过程。除了m6A，mRNA上还存在另一种动态可逆的化学修饰m6Am，该修饰位于转录起始位置，与帽子结构相邻。近年来，哺乳动物细胞系和组织的m6Am修饰图谱已有研究，但现有的测序技术面临着灵敏度低、特异性差、依赖甲基转移酶敲除的细胞系等问题，阻碍了m6Am功能研究的发展。因此，开发一种直接、特异、灵敏的方法检测m6Am修饰至关重要。

本研究基于优化的去甲基化反应体系和RNA免疫沉淀技术，开发了m6Am的特异检测技术——m6Am-seq，获得了全转录组m6Am和5’UTR m6A的分布，绘制了单碱基分辨率的m6Am修饰图谱。相比于其他测序技术，m6Am-seq有更高的信噪比和准确度。利用m6Am-seq，检测到在细胞热激和低氧条件下，m6Am和5’UTR m6A的修饰水平均发生了动态变化，参与细胞应激调控过程的关键基因上也发生了修饰水平的变化。(生物谷Bioon.com）