复旦大学发表最新Nature论文

长链非编码 RNA（lncRNA），是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA，它们通常不编码蛋白质，广泛存在于真核生物、细菌以及病毒中，在生命活动的诸多方面发挥着重要的调控作用。

通过比较基因组学分析，在细菌和噬菌体中已鉴定出 20 多类 lncRNA，但它们的生物学功能在很大程度上仍未被探索。由于大多数 lncRNA 的尺寸较大，其结构决定因素也仍未得到表征。

2025 年 6 月 16 日，复旦大学麻锦彪教授、Xiaobin Ling，马萨诸塞大学医学院 Wenwen Fang 等人在国际顶尖学术期刊 Nature 上发表了题为：Cryo-EM structure of a natural RNA nanocage 的研究论文。

该研究解析了在细菌和噬菌体基因组中发现的长链非编码 RNA ROOL 形成的两种天然 RNA 纳米笼的高分辨率冷冻电镜结构，这项研究结果或可用于设计新型 RNA 纳米笼，作为研究和治疗应用的 RNA 载体。

在这项最新研究中，研究团队报告了在细菌和噬菌体基因组中发现的长链非编码 RNA ROOL 形成的两种天然 RNA 纳米笼的结构。

~2.9 Å 分辨率的冷冻电镜（cryo-EM）结构显示，ROOL RNA 形成一个直径为 28 纳米、轴向长度为 20 纳米的八聚体纳米笼，其内部中空区域存在排列无序区。该八聚体通过众多三级和四级相互作用得以稳定，其中包括三链 A型小沟（A-minor），研究团队提议将其命名为“A型小沟订书钉”（A-minor staple）。在 ~3.2 Å 的分辨率下，孤立的 ROOL 单体的结构表明，纳米笼的组装涉及一种链交换机制，从而形成四级亲吻环。

最后，研究团队证明了与 RNA 适配体、tRNA 或 microRNA 融合的 ROOL RNA 能够保持其结构，形成一个具有径向展示货物的纳米笼。

这项研究结果或许能够用于设计新型 RNA 纳米笼，作为研究和治疗应用的 RNA 载体。