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新型非编码RNA:LncRNA剪接变异体的不同调控功能和生物学作用

来源:生物谷原创 2023-05-22 14:49

人类基因组由大约22,000个蛋白质编码基因(PCG)组成,这些基因能够通过选择性剪接(AS)产生不止一个转录本。

人类基因组由大约22,000个蛋白质编码基因(PCG)组成,这些基因能够通过选择性剪接(AS)产生不止一个转录本。基因转录产生一个可经受各种剪接事件的前mRNA分子,由于许多基因中存在跳过的外显子(SE)、选择性的30个剪接点(A3SS)、选择性的5‘剪接点(A5SS)、互斥的外显子(MXE)和内含子保留(IR),从而产生过多的剪接变异体。

因此,前信使核糖核酸分子可以显著增加转录组的复杂性,从而扩大蛋白质组的多样性。在人类中,90%-95%的多外显子基因产生选择性剪接的RNA转录本,因此AS的广泛使用强调了AS的重要性。

事实上,AS是一个高度动态的过程,影响细胞生物学的许多方面,因此对于在分化和发育过程中产生成年组织和组织身份至关重要。然而,PCG的外显子组只占整个人类基因组的2%。

图片来源:https://doi.org/10.1016/j.omtn.2023.03.004.

近日,来自加拿大的研究者们在Molecular Therapy: Nucleic Acids杂志上发表了题为“Distinct regulatory functions and biological roles of lncRNA splice variants”的综述性文章,该研究总结了LncRNA剪接变异体的不同调控功能和生物学作用。

RNA分子的选择性剪接(AS)是转录组多样性的关键因素。在人类中,90%-95%的多外显子基因产生选择性剪接的RNA转录本。因此,每个基因都有机会产生多种剪接变体,包括经过RNA成熟步骤(如常规剪接和选择性剪接)的长非编码RNA(LncRNA)基因。

新出现的证据表明,这些lncRNA剪接变异体在细胞生物学的许多方面发挥着重要作用。特定的lncRNA剪接变异体表达的不同变化也与包括癌症在内的许多疾病有关。这篇综述涵盖了关于这一新兴调查主题的当前知识。

研究者对lncRNAs的AS景观提供了独家见解,并在分子水平上描述了lncRNA剪接变体的功能相关性,即基于RNA的差异功能、微肽的产生和环状RNA的产生。最后,研究者讨论了这一新兴领域令人兴奋的前景,并概述了进一步发展该领域研究努力所需的工作。

利用lncRNA剪接变异体生产微肽

图片来源:https://doi.org/10.1016/j.omtn.2023.03.004.

总之,除了其谱系的扩展外,lncRNA剪接变异体的功能鉴定是该领域未来几年的一大挑战。到目前为止,在功能水平上研究的lncRNA变体相对较少,它们的生物学意义仍然不清楚。然而,越来越多的证据表明,由于调控失调与癌症的进展或疾病的发展密切相关,因此提供了有希望的和有价值的预后和诊断生物标记物。

开发新的治疗方法(如ASOS)非常重要,因为lncRNA剪接变异体可能提供很强的临床相关性。然而,在考虑任何治疗应用之前,促进我们对这些lncRNA剪接变体的功能作用的理解是至关重要的。(生物谷 Bioon.com)

参考文献

Muhammad Riaz Khan et al. Distinct regulatory functions and biological roles of lncRNA splice variants. Mol Ther Nucleic Acids. 2023 Mar 15;32:127-143. doi: 10.1016/j.omtn.2023.03.004.

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