全文编译！流行病学研究揭示COVID在意大利伦巴第地区的早期流行趋势
来源：本站原创 2020-04-05 23:57
根据最近发表在预印本学术平台arXiv网站上的一篇文章，来自意大利博科尼大学，米兰大学等机构的研究者们揭示了在首例病例确诊之前，意大利境内伦巴第（Lombardy）早期的COVID19流行趋势。
2020年4月6日讯/生物谷BIOON/---根据最近发表在预印本学术平台arXiv网站上的一篇文章，来自意大利博科尼大学，米兰大学等机构的研究者们揭示了在首例病例确诊之前，意大利境内伦巴第（Lombardy）早期的COVID19流行趋势。
2020年2月20日晚，在意大利的伦巴第大区确认了首例新型冠状病毒病（COVID-19）。 该患者是一名38岁的健康男性，患有轻度肺炎，没有相关的旅行史，也没有明显接触患病人群的经历。在随后的一周中，伦巴第地区的病例数量迅速增加。对此，研究者们对伦巴第地区报告的首批5830例实验室确诊病例进行了相关分析（统计症状发生日期为2020年1月14日至2020年3月8日），包括对上述确诊病例进行的流行病学分析，背景人口统计和暴露特征分析，以及该区域内感染的传播动态等等。此外，研究者们还基于报告病例的子样本进行病毒学特征分析，从而对有症状和无症状的病例的病毒载量水平进行了初步评估。该研究为西方国家早期的COVID19传播提供了新的线索。
首先，作者通过对确诊病例及其亲密接触者进行标准化访谈收集到了相关的流行病学数据。并且同时收集了人口统计背景，症状发作的日期，临床特征，呼吸道标本检查结果，住院以及相关接触者的追踪情况。
作者将所有患者根据症状的发生日期进行了分类汇总（下图）。如上所述， 截至2020年3月8日，伦巴第大区所有省份共报告了5830例阳性病例。 其中首例患者于2月20日确诊，第二天同一地区发现了28例阳性病例。由于病例激增，2月23日当地政府出台了包括红色预警，区域封锁在内的相关措施。
下图展示了不同时期伦巴第地区COVID19的传播情况。总之，在伦巴第地区COVID-19流行的早期阶段，作者观察到在科多诺（Codogno），贝加莫（Bergamo）和克雷莫纳（Cremona）等城市周围发现了三个主要感染群的形成。 后来，该流行病开始在整个地区开始广泛传播。 截至3月5日，在贝加莫，洛迪（科多诺所在的地方）和克雷莫纳等省发现了大多数病例（72％）。
之后，作者按患者的症状发生时间分成三个阶段分别分析其特征：第一个时期为从最早有患者出现症状开始，直到2月19日，即官方宣布确诊的首个病例的前一天为止。第二个阶段是在2月20日至2月25日之间出现症状，即出台相关政策要求停止对COVID-19病患的无症状接触进行检测的前一天为止；第三阶段从2月26日开始出现症状的病例到最后为止。为了与其余分析保持一致，我们排除了明确报告为无症状的病例（n = 204）。从剩余的样本库（n = 5,626）中，作者发现阳性病例的中位年龄为69岁（范围为1个月至101岁），其中一半以上的病例发生在65岁以上（75岁以上的病例为34%），阳性患者的62％为男性。几乎有一半的病例住院（47％）。在三个组中，分别有63％，61％和56％的病例住院。在这些住院患者中，有18％需要重症监护。总体而言，伦巴第地区共有346人死亡，老年组的病死率（CFR）最高（75岁以上人群病死率为14％）。
通过对症状发作时间进行进一步分析，作者估计病患从感染到症状发生之间的时间间隔为6.6天，（从0.7天到19.0天，百分比分别为2.5％和97.5％）。 因此，作者认为95％的病例在感染后的16.1天内会出现症状。
之后，作者分析了伦巴第地区及内部不同感染亚区的病毒蔓延速率。结果显示，COVID从最初感染至今，其传播速率呈“先上升后下降”的趋势（Rt值表示在给定的时间内病毒在人群中的扩散程度）。作者认为，自2月20日以来，病毒的扩散速率已经出现下降的趋势。
从2月21日至3月3日，伦巴第地区总共有7,925支鼻拭子样品接受了检测，其中SARS-Cov-2的阳性样品为2,251份。 对来自Pavia参考实验室的部分样品数据进行了更深入的分析（6208名受试者），结果1529名为阳性。在2月21日当天检测的380名阳性受试者中，有17名（4.5％）被确定为无症状，有295名（77.6％）被分类为有症状，此外还有68名患者（17.8％）没有明确迹象表明存在症状。 在2月27日至3月3日期间，仅对有症状的原发病例及其有症状的接触者进行了检测，检出率提高到了33.4％（1,107 / 3,316）。
通过比较不同亚组患者样品中的病毒RNA拷贝量，作者发现有症状患者样品中位SARS-CoV-2水平为5.0 X Log10 RNA copy/ ml（范围1.7-10.1），无症状患者为4.7 X Log10 RNA copy/ ml（范围2.1-7.1） 有症状患者和无症状患者样品中的病毒载量无统计学差异。
根据调查结果，研究者们认为：COVID19在意大利境内的流行实际上早在2020年2月20日之前就已经开始。在发现第一例COVID-19病例时，该疾病已在南部伦巴第的大部分城市中广泛传播。
根据估计，意大利伦巴第地区患者从感染到症状出现平均间隔为6.6天，介于中国湖北省（平均7.5天）和其他中国省份（平均5.1天）之间。 作者认为我国其它省份的时间间隔比伦巴第地区少1.5天的原因是伦巴第的COVID-19病例没有像在中国的那些省份那样被迅速隔离，因此继续传播感染时间更长。 在流行的指数增长阶段，作者估计其平均R0值在2.3-3.1质检。 每天的繁殖数量随时间波动很大，但在各个地理区域内却相当一致。 2月20日之后Rt值会略有下降。但是仍远高于流行阈值。
由于COVID-19的传播潜力非常高，而且在极短的时间内就会积累很多危急病例，因此会对医疗保健系统造成严峻的挑战。目前研究者们观察到病毒的传播速率略有下降，这可能与人口意识的提高和干预措施发挥效果有关。 对此，需要继续采取积极的遏制策略来控制COVID19的传播以及对医疗系统造成的灾难性后果。（生物谷 Bioon.com）
参考文献：Cereda D et al., The early phase of the COVID-19 outbreak in Lombardy, Italy. 2020. arXiv
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