《自然·医学》:预测肺腺癌脑转移的方法来了!科学家开发甲基化模型高准确度预测肺腺癌脑转移风险,可无创区分脑转移与其他脑肿瘤
来源:奇点糕 2024-10-13 11:22
在肺腺癌脑转移缺乏预测标志物的情况下,这项研究提供了一种高准确性的脑转移预测方法,尤其是无创鉴别脑转移和其他脑瘤,具有显著的临床价值。
多伦多综合医院及多伦多大学科研团队在《自然·医学》杂志发文,研究者们收集了四百余份肺腺癌患者的肿瘤和血浆样本,构建了肺腺癌DNA甲基化特征模型,用于预测患者的脑转移风险。
该模型预测效果不仅优于临床特征,还可以仅凭血浆甲基化标志物对脑转移和其他脑瘤进行准确区分,可以成为神经影像学难以处理的肿瘤的“照妖镜”。
研究者首先对166例原发肺腺癌临床注释队列进行了分析,综合详细临床数据筛选甲基化谱,共确定了5553个差异甲基化CpGs可以有效预测脑转移的发展,并依此构建了预测模型。
研究者在独立的验证队列中测试了模型效果,预测的患者脑转移高、中、低风险分层符合生存曲线,且效果独立于临床因素。
整合临床预后因素后,模型可以更好地预测5年内脑转移的发展,AUROC高达0.82。
研究者还分别测试了不同疾病负担和分子亚型,甲基化模型都能起到不错的预测效果。
研究者观察到,与脑转移密切相关的染色体和基因水平的拷贝数改变中,预测效果最强的有 8q23.2、21q21.3、ACTG2、BLM、FGFR3、MCL1、CCND1、EGFR、MDM2和MYC,仅有后四者曾被报道。
脑转移与其他的脑肿瘤不易区分,研究者尝试通过血浆甲基化生物标志物鉴别脑转移和神经胶质瘤/CNS淋巴瘤等主要脑瘤类型,最终得到的模型AUROC达到0.8。
模型构建流程
不过该模型在肺鳞癌(LUSC)中表现不佳,说明肺鳞癌和肺腺癌之间存在较大的甲基化差异。
总而言之,在肺腺癌脑转移缺乏预测标志物的情况下,这项研究提供了一种高准确性的脑转移预测方法,尤其是无创鉴别脑转移和其他脑瘤,具有显著的临床价值。
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