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Mol Cell:白血病相关蛋白竟“不挑食”,RNA如何让基因调控机器自动停摆?

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来源:生物谷原创 2026-09-30 10:43

研究人员通过研究发现,WDR5与RNA的结合远非“专一”,而是“广泛而随意”的—它几乎不挑序列,主要看RNA的丰度和长度。

在基因调控的世界里,染色质修饰复合物长期被视为高度精密的“分子机器”,其决定着DNA在细胞核中如何缠绕、哪些区域开放、哪些基因被读取。MLL1/KMT2A复合物便是其中关键一员,它通过催化组蛋白H3第4位赖氨酸甲基化(H3K4me)来维持HOX等发育与生长基因的正常表达;然而,这套机器一旦失控,后果可能极为严重—MLL基因重排与突变是急性髓系白血病(AML)尤其是婴幼儿AML的重要驱动因素。正因如此,科学家一直试图弄清:MLL1复合物究竟如何被招募到特定基因上,又是如何被适时关闭的?

过去主流观点认为,长链非编码RNA像“地址标签”一样,通过识别特定序列把MLL1复合物及其关键亚基WDR5引导到目标基因;但一篇发表在国际杂志Molecular Cell上题为“Promiscuous RNA binding by WDR5 remodels the KMT2A (MLL1) histone methyltransferase complex to an inactive state”的研究报告颠覆了这一认知,文章中,来自芝加哥大学等机构的研究人员通过研究发现,WDR5与RNA的结合远非“专一”,而是“广泛而随意”的—它几乎不挑序列,主要看RNA的丰度和长度。

这项研究中,研究人员采用严格的方法鉴定与WDR5相互作用的细胞RNA,结果捕获到大量不同类型的RNA,体外平衡结合实验进一步显示,决定结合亲和力的核心因素是RNA长度,而非特定序列;这意味着,WDR5并不是在寻找某个“暗号”,而是在感知周围RNA的整体数量与规模;更重要的是,WDR5结合RNA的界面,恰好与MLL1复合物中亚基之间的蛋白-蛋白相互作用界面高度重叠。

这一发现引出了一个令人意外的机制:当周围RNA积累到一定程度,它们会竞争性地把WDR5从MLL1复合物的关键蛋白接口上“挤开”,导致复合物解体,H3K4甲基化活动随之显著下降。换言之,RNA不仅是招募者,还可能充当“自毁开关”。Kainth描述道,目前的工作模型是:一定量的RNA有助于招募MLL1复合物,基因激活后产生大量邻近RNA,而高浓度RNA最终关闭了当初激活它的复合物—一个典型的负反馈环路。

WDR5在细胞中的非特异性RNA结合参与其染色质的结合过程

这一机制为理解白血病中MLL1的失控提供了新线索,癌症常表现为基因活动的“刹车失灵”,如果MLL1复合物因突变而无法在产生足够RNA后正常解散,基因激活便可能持续进行;已有研究表明,HOX基因过度表达且不能被正常关闭,可在小鼠中引发白血病。Ruthenburg指出,正常条件下的负反馈在白血病中可能效率低下,而这种现象在不同MLL突变中较为常见,逻辑上是一致的。

这项研究的亮点可归纳为四点:WDR5以与RNA丰度成比例的方式广泛结合细胞RNA;体外结合亲和力由RNA长度而非序列决定;RNA占据的WDR5表面与MLL1复合物界面重叠;RNA通过竞争性置换WDR5、破坏MLL1组装,从而抑制H3K4甲基化。这些发现不仅修正了此前关于“特异性RNA招募”的模型,也拓展了人们对RNA调控染色质修饰复合物方式的理解——RNA不必编码蛋白质,也无需精确配对,仅凭数量与长度即可参与调控。

从临床角度看,AML中MLL重排患者的预后通常较差,尤其在婴幼儿群体中,治疗选择有限。这项研究并未直接提出新疗法,但其揭示了一个可能被白血病利用的调控弱点:如果RNA介导的复合物解聚是正常关闭MLL1的重要途径,那么恢复或模拟这一过程或能成为未来干预的思路,当然,这仍需大量后续研究验证。(生物谷Bioon.com)

参考文献:

Amoldeep S. Kainth,Pallavi Sirjoosingh,Michael S. Werner, et al.Promiscuous RNA binding by WDR5 remodels the KMT2A (MLL1) histone methyltransferase complex to an inactive state, Molecular Cell (2026). DOI:10.1016/j.molcel.2026.08.008.

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