PLoS Biol:肠道微生物的秘密 科学家揭示真菌、基因与机体健康之间的奇妙关联
来源:生物谷原创 2025-09-05 10:18
研究人员首次对肠道真菌与人类遗传变异之间的关系进行了全基因组关联研究(GWAS),旨在探索人类遗传变异如何影响肠道真菌的组成以及这些真菌如何与慢性疾病风险相关联。
近年来,肠道微生物的研究在全球范围内掀起了一股热潮,从肥胖、糖尿病到心血管疾病,肠道微生物与人类健康的关联被不断揭示,WHO数据显示,心血管疾病是全球导致人类死亡的主要原因之一,每年约有1790万人因此丧生,而在这一庞大的健康问题背后,肠道微生物的作用逐渐浮出水面。
近日,一篇发表在国际杂志PLoS Biology上题为“Gut fungi are associated with human genetic variation and disease risk”的研究报告中,来自宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家们通过研究首次揭示了肠道真菌与人类遗传变异及疾病风险之间的联系,从而为这一领域带来了新的研究曙光。
文章中,研究人员首次对肠道真菌与人类遗传变异之间的关系进行了全基因组关联研究(GWAS),旨在探索人类遗传变异如何影响肠道真菌的组成以及这些真菌如何与慢性疾病风险相关联。研究者使用了人类微生物组计划(Human Microbiome Project, HMP)的数据,主要涵盖了125名健康志愿者的肠道真菌(通过ITS测序)和全基因组测序数据。
真菌的相对丰度或能以一种组织特异性相对基因表达的方式与真菌相关突变体-表达数量性状位点(FAV-eQTLs)和变异相关
这项研究中,研究人员采用了先进的生物信息学工具和统计方法,首先对肠道真菌的测序数据进行处理同时去除低质量的序列,并将真菌分类到属水平;随后他们利用PLINK软件对约500万个人类遗传变异进行分析来确定这些变异与44种常见真菌类群之间的关系,结果发现了148个与肠道真菌相对丰度相关的遗传变异(FAVs),这些变异分布在7条染色体上,且与9种真菌类群相关联。
研究者指出,某些遗传变异与特定真菌类群的丰度密切相关,比如与心血管疾病相关的CDH13基因中的变异与肠道酵母菌Kazachstania的丰度有关;进一步分析表明,Kazachstania的丰度与冠状动脉疾病风险存在因果关系;此外,肠道真菌的丰度与宿主基因表达之间也存在一定关联,这或许会影响机体的心血管健康和抗真菌免疫。
综上,这项研究首次揭示了人类遗传变异、肠道真菌和慢性疾病之间的复杂联系,其不仅扩展了科学家们对肠道微生物组的认识,还为未来的个性化医疗提供了新的方向,通过了解特定遗传变异如何影响肠道真菌的组成,研究人员就能更好地预测和预防慢性疾病;同时这项研究还强调了扩大样本量和研究不同人群的重要性,以便研究人员能更全面地理解这些复杂的相互作用。(生物谷Bioon.com)
参考文献:
Emily P. Van Syoc,Emily R. Davenport,Seth R. Bordenstein. Gut fungi are associated with human genetic variation and disease risk, PLOS Biology (2025). DOI:10.1371/journal.pbio.3003339.
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