非编码RNA重磅综述：长非编码RNA与人类肝病

长非编码RNA(LncRNAs)在基因组中广泛转录，具有多种生物学功能，并通过多种机制发挥作用。人类基因组中lncrna的绝对数量已经提出了关于它们在人类健康和疾病中的潜在生物学意义和作用的重要问题。技术和计算的进步使大量的lncrna得以功能注释。虽然近年来与lncrna相关的文章数量不断增加，但关注肝脏生理和病理的文章相对较少。作者概述了lncRNA分类系统和特征的发展，并强调了我们在理解lncRNA对肝病的贡献方面的重要进展，重点是非酒精性脂肪性肝炎、肝癌和胆汁瘀积性肝病。

图片来源：https://doi.org/10.1146/annurev-pathol-042320-115255

虽然大多数人类基因组被转录为RNA，但转录序列中只有13%对应于蛋白质编码基因。被转录的人类基因组的其余部分包括一系列功能重要的元素，包括非蛋白质编码转录本，如核糖体RNA、转移RNA、小核RNA、小核仁RNA microRNAs (miRNAs)、pii相互作用RNA、小干扰RNA (sirna)、启动子相关RNA、增强RNA (eRNAs)和其他。构建一个包含全部非编码和编码RNA转录本的全面一致的人类转录组，鉴定出近60000个长非编码RNA (lncrna)，它们代表了几乎70%的表达基因。

人类基因组中大量的lncrna提出了关于它们潜在的生物学相关性、大量的lncrna的数量和多样性的重要性以及这些分子在人类健康和疾病中的作用的重要问题。此时，作者对lncRNA作为一个群体的认识，包括lncRNA的特点和分类策略，正在不断增长，但还不完全。

LncRNA由一组异源的非编码RNA组成，根据转录本长度>200个核苷酸进行松散分类。lncrna通过复杂的三维相互作用和构型与DNA、RNA和蛋白质结合，并参与广泛的生物学活动，包括蛋白复合物的调节、基因表达的调节、组蛋白修饰物到染色质的招募、染色体失活、多能性和分化，以及可变剪接的调控。

迄今为止积累的证据支持lncrna作为与人类疾病的发病和进展相关的生物通路的重要调节者的作用。然而，虽然许多研究使用体外模型描述了lncrna的功能，但相对较少的研究使用体内方法来获得特定转录本的全面、上下文特异性注释。此外，尽管近年来与lncrna相关的论文数量呈指数级增长，但对涉及人类肝脏生理和病理的lncrna的关注相对较少。

人-鼠lncRNAs同源基因数目的比较

图片来源：https://doi.org/10.1146/annurev-pathol-042320-115255

近年来，我们对lncRNAs的了解迅速发展，并继续快速增长。尽管有这样的势头，但仍有许多有待发现的地方。例如，人类基因组中有多少部分的lncRNAs是有功能的？lncRNAs在多大程度上对人类疾病的发病有贡献？与lncRNA注释相关的问题仍然存在，很大程度上是因为lncRNAs的低表达、对lncRNA序列-功能关系的有限理解以及物种间lncRNA的弱保守性阻碍了注释工作。

目前，绝大多数lncRNA的生物学意义仍然知之甚少，甚至lncRNA这个术语本身也需要修改，以反映目前在这一名称下归类的基因的广泛多样性。改进的注释、定位和筛选方法;更好的生物模型;我们需要更有效的方法来研究lncrna的治疗潜力。（生物谷 Bioon.com）

参考文献

Johanna K DiStefano et al. Long Noncoding RNAs and Human Liver Disease. Annu Rev Pathol.2021 Aug 20.DOI: 10.1146/annurev-pathol-042320-115255.