Cancer Res：科学家识别出基于肿瘤的甲基化模式或许能作为特殊的癌症生物标志物

在癌症治疗过程中，生物标志物通常能被用来指导疗法的决策和预测患者的治疗结局，然而，研究人员通常很难识别出适当的生物标志物，这些标志物能够持续复制并且很容易利用有限的患者样本来进行分析，近日，一篇发表在国际杂志Cancer Research上题为“Tumor Expression Quantitative Trait Methylation Screening Reveals Distinct CpG Panels for Deconvolving Cancer Immune Signatures”的研究报告中，来自Moffitt癌症研究中心等机构的科学家们通过研究根据一种被称为甲基化的遗传修饰来识别出特殊的生物标志物，其或能用来预测肿瘤免疫环境的类型和患者的治疗结局。

科学家识别出基于肿瘤的甲基化模式或许能作为特殊的癌症生物标志物。

图片来源： Pixabay/CC0 Public Domain

基因往往会受到特定修饰的高度调节，这些修饰要么会促进或阻断基因的表达，一种类型的表观遗传学修饰称之为甲基化，其主要包括将甲基化基团添加到基因的特定区域，通常情况下，基因启动子区域高水平的甲基化往往与较低水平的基因表达有关，最近，有研究表明，基因甲基化的模式或许是一种潜在的生物标志物，利用甲基化作为生物标志物相比利用基因表达生物标志物而言往往拥有多个优势，包括可重复性和稳定性，这些特性或许就使其更易于在临床上使用，不同的测试技术之间的差异较小，以及能利用冷冻或固定在甲醛中并嵌入到石蜡中的组织标本。

目前，细胞溶解活性评分是一种成熟的生物标志物，其能基于基因表达来预测肿瘤浸润性淋巴细胞的存在，肿瘤浸润性淋巴细胞是一类能从血液中移出并进入肿瘤的特殊免疫细胞，肿瘤中高水平的肿瘤浸润性淋巴细胞或与患者预后改善直接相关，细胞溶解活性评分或能通过测定基因表达的模式来预测肿瘤浸润性淋巴细胞的存在，尤其是细胞毒性T细胞。这项研究中，研究人员想通过研究识别出那些比常用的生物标志物更好的生物标志物，比如细胞溶解活性评分（用于识别冷/热肿瘤），研究人员提出了基于肿瘤的表达定量形状甲基化的概念，即将基因甲基化模式与基因表达相关联来识别出潜在的生物标志物。研究人员专注于将黑色素瘤作为一种疾病模型，并评估是否其能识别出特定的甲基化特征，从而帮助预测肿瘤的免疫环境是什么样子以及患者的治疗结局。

原始出处：https://aacrjournals.org/cancerres/article-abstract/82/9/1724/694708/Tumor-Expression-Quantitative-Trait-Methylation?redirectedFrom=fulltext

随后研究人员发现，黑色素瘤样本的甲基化序列或能作为细胞溶解活性评分的替代生物标志物，并能预测肿瘤中免疫环境的类型，通过进行更有针对性的靶向性分析，研究人员确定，称之为TCF7的单一基因的甲基化模式或能帮助预测是否肿瘤中的T细胞具有抗肿瘤特性，结果发现，TCF7的特征结合细胞溶解活性得分或能帮助预测患者的治疗结局。具体而言，具有较低TCF7特征和较高细胞溶解活性得分的黑色素瘤患者相比其它特征组合的患者而言拥有较长的生存期，研究人员证实了在其它肿瘤中较低TCF7特征/较高细胞溶解活性评分之间的关联，包括肾脏癌症、食道癌等，此外，研究人员还确定，TCF7的特征或能用来预测不依赖于其它变量的患者的结局。

研究者Xuefeng Wang指出，尽管后期还需要进行更多的研究，目前的分析结果表明，通过基于肿瘤的表达定量特征甲基化筛查来确定免疫组学状态或能帮助准确预测患者的治疗结局，这一研究发现也为解锁用于个性化疗法决策的潜在新型靶点提供了新的希望，其类似于指纹或虹膜扫描，就好像杂志封面艺术中的那样。综上，本文研究结果表明，基于肿瘤的基因表达定量特征甲基化模式或许代表了一类不同的潜在生物标志物，其或能用于预测患者的治疗预后和机体免疫状态。（生物谷Bioon.com）

原始出处：

Xiaoqing Yu，Ling Cen，Y. Ann Chen, et al.Tumor Expression Quantitative Trait Methylation Screening Reveals Distinct CpG Panels for Deconvolving Cancer Immune Signatures, Cancer Research (2022). DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-21-3113