Nat Commun：揭示在所有人类癌症中常发生的基因突变

2021年10月21日 讯 /生物谷BIOON/ --突变在癌症发生的过程中扮演着非常重要的角色，而且很多突变都会产生可供靶向作用的弱点，而确定包含基因突变形式的人群中所有癌症患者的比例，对于公共卫生和基础科学研究都有一定的好处；在过去的15年里，癌症研究人员已经利用DNA测序技术识别出了引发多种形式癌症的基因突变。近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Cancer gene mutation frequencies for the U.S. population”的研究报告中，来自索尔克研究所等机构的科学家们通过研究将基因突变信息与癌症发病率数据相结合揭示了美国整个癌症患者群体中的癌症遗传基础。

揭示在所有人类癌症中最常发生的基因突变。

图片来源：Mendiratta, G., et al. Nat Commun 12, 5961 (2021). doi：10.1038/s41467-021-26213-y

文章中，研究人员揭示了在癌症患者群体中，基因组中的每个基因突变的普遍程度，相关研究结果有望帮助指导遗传学研究，并开发比相比目前更加有效的治疗性手段。本文研究还回答了一个非常基本的问题，即人类癌症中最常见的突变基因是什么，令人惊讶的是，针对这一问题，目前研究人员尚没有得到答案。

遗传突变在癌症的发生和进展过程中发挥着重要作用，其能被有效的疗法所靶向作用，然而，由于很多研究都识别出了参与特定癌症的突变，比如乳腺癌和淋巴瘤等，但从来没有人设法将这些数据结合起来，从而揭示整个癌症患者群体中最常见的基因突变，每种癌症都是不同的，这或许就会使得确定哪种致癌基因以及哪种药物靶点应该优先进一步研究成为了科学家们所面临的挑战。

这篇研究报告中，研究人员将来自基因组和流行病学癌症研究的数据结合起来，确定了所有癌症患者中到底有多少百分比的患者会携带任何基因突变，尽管这项任务最初看起来很简单，但很快研究人员就发现了这个问题为何以前没有答案了，基因组学和流行病学研究没有对多种癌症使用一种共同的命名系统，比如，一些研究人员按照机体上的位置来对癌症进行分裂，而另一些研究人员则利用肿瘤类型来分类，还有很多研究人员使用上述两种分类标准来进行分类，这或许就使得很多数据集难以进行统一，而这对于确定不同的基因突变到底有多普遍至关重要。

图片来源：https://www.nature.com/articles/s41467-021-26213-y

为了克服这一挑战，研究人员仔细分析了200多项研究，并根据一种一致的命名系统来单独分析并对每一种癌症进行重新分类，随后他们比较了数据集，考虑到了一些癌症相比其它癌症更常见的特征或事实；当研究人员分析这些数据时，他们发现了一些普遍存在的观点或许是不准确的，比如，KRAS是一种重要的促癌基因，其被认为在25%的癌症类型中都处于突变状态，相反，其被发现仅存在于大约11%的癌症中，这或许就是趋势的一部分，即个别基因突变被发现要比此前认为的更要少见。

研究者Stites说道，这些研究发现就说明我们很有必要重新评估人们一直以来将时间、注意力和资源集中的研究领域；而我们也应该在癌症的不同遗传原因上更均匀地付诸努力进行研究，同时也应该在不同的主要治疗策略上更加均匀地平衡新型癌症疗法的发展，因为靶向作用特定突变的概念将比假设的影响要更小一些。综上，本文研究结果表明，研究者所发现的癌症遗传学或许并不像局限于一部分癌症类型的研究所认为的被高频率且高知名度的癌症驱动基因所支配。（生物谷Bioon.com）

原始出处：

Mendiratta, G., Ke, E., Aziz, M. et al. Cancer gene mutation frequencies for the U.S. population. Nat Commun 12, 5961 (2021). doi：10.1038/s41467-021-26213-y