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Delta和Omicron的混血儿"Deltacron"身世成谜

  1. 病毒

来源:生物探索 2022-01-14 08:35

  Kostrikis表示Deltacron结合了Delta和Omicron的基因,可能来自同时感染Delta和Omicron的患者。该项研究的25个突变样本采集自塞浦路斯,其中11个样本采集自住院新冠患者,14个样本采集自普通感染人群。相较而言,住院患者样本的突变频率更高,这可能意味着 Deltacron 与住院治疗之间存在相关性,因此

 

 

 

 

Kostrikis表示Deltacron结合了Delta和Omicron的基因,可能来自同时感染Delta和Omicron的患者。该项研究的25个突变样本采集自塞浦路斯,其中11个样本采集自住院新冠患者,14个样本采集自普通感染人群。相较而言,住院患者样本的突变频率更高,这可能意味着 Deltacron 与住院治疗之间存在相关性,因此,Deltacron的致病性和传染性需要引起重视。此外,针对Deltacron的研究数据已提交给GISAID全球数据库。

新冠病毒重组变异体的出现,引起了广泛关注,一些专家针对该变异体的真伪展开了讨论。蒙特利尔麦吉尔大学健康中心研究所的遗传学家 FatimaTokhmafshan在推特上表示病毒并不是重组的而是实验室污染所致,通过查看塞浦路斯最近提交的GISAID聚类和突变谱并没有发现突变共识;世卫组织 Covid专家Krutika Kuppalli 博士对此表示赞同,她在推特上表示在Delta 样本中检测到的Omicron组分,可能是因为样本在实验室受到污染导致的测序伪影所致,而非出现新的重组病毒;与此同时,伦敦帝国理工学院的病毒学家Tom Peacock博士也在推特上表示媒体报道的Deltacron序列明显是样品受到污染导致的。别的专家也看过Deltacron的序列信息,我们得出了一致结论:Deltacron看起来不像是真正的病毒重组,而更像是样本污染的结果;另一位知名科学家-亚特兰大埃默里大学传染病专家Boghuma Kabisen Titanji博士持谨慎态度,并在周日发推文表示关于Deltacron 的结论,仍需持谨慎态度,而目前可用的信息均指向样本的污染,而不是delta和omicron 的真正重组。

在此之前,针对新冠病毒的基因重组,已有报道。2021年10月11号发表于Medrxiv,名为“Genome Recombinationbetween Delta and Alpha Variants of Severe Acute Respiratory SyndromeCoronavirus 2 (SARS-CoV-2)”的文章报道了在日本发现的Delta和Alpha的重组变异体(AY.29+B.1.1.7)。通过Nexstrain对这一发现的数据进行系统进化树分析证实了该重组病毒序列可在同一个簇中找到。然而通过对Deltacron的数据进行同样的分析时发现其几乎分布在每个分支,并没有日本发现的重组病毒的簇状分布特征。

除此之外,在其他Delta分支中具有 Omicron 的完整ARTIC引物测序扩增子,这是ARTIC引物方案中扩增子72的失败导致的,因为这些序列中的所有 Omicron突变(即A67V、H69_V70del、T95I、G142D、V143_Y145del)都在该扩增子中,然而来自其他样品的低水平污染物填补了空白,因此重组扩增子的可能性约为0。(生物谷Bioon.com)

 

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