Cell Rep：新型lncRNAs或能作为癌症患者的新型预后生物标志物和驱动癌症发生的关键基因

2021年11月23日 讯 /生物谷BIOON/ --长链非编码RNAs（lncRNAs）如今越来越被认为是癌症的功能单元以及强大的生物标志物，然而大多数的lncRNAs仍然并未被描述过；近日，一篇发表在国际杂志Cell Reports上题为“Pan-cancer analysis of non-coding transcripts reveals the prognostic onco-lncRNA HOXA10-AS in gliomas”的研究报告中，来自多伦多大学等机构的科学家们通过在癌症中分析lncRNAs揭示了一组166个预后生物标志物目录。此外，该目录中的一种生物标志物或能有效分类高风险和低风险的胶质瘤（一种脑癌），相关研究结果揭示了lncRNAs作为临床生物标志物和潜在治疗性靶点的潜力，相关研究结果或解释了非编码RNA失调在癌症发生过程中扮演的关键角色。

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这篇研究报告中，研究人员利用机器学习手段对来自30种不同癌症类型近9500份样本中的5600中潜在的lncRNA生物标志物进行了分析评估，最后他们发现其中166种lncRNAs与癌症患者的生存直接相关；在临床环境中，这些生物标志物或能潜在被用来增强临床变量、分子特征和癌症亚型在预测患者治疗结局上的价值。

在目录中，研究人员锁定了一种名为HOXA10-AS的lncRNA，研究人员最初利用机器学习分析揭示，HOXA10-AS或是一种强大的候选子，其能作为一种预后生物标志物来对高风险和低风险脑癌患者进行分类。为了证实机器学习分析所产生的结果，研究人员在中国上海华山医院所开发的一种新型脑癌数据集中进行了相关测试。随后研究人员转向利用患者机体衍生的癌细胞、异种移植物和类器官模型进行功能性的生物学验证，这些步骤不仅证实了HOXA10-AS能作为一种强大的生物标志物，而且由于其在脑癌的多种重要的生物学通路中扮演着重要角色，其或许还能作为一种潜在的治疗性靶点，比如，过量表达HOXA10-AS或与细胞侵袭水平增加有关，而降低HOXA10-AS的表达水平则会抑制细胞增殖，这些均是脑癌发生的重要标志。

图片来源：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)01340-1?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124721013401%3Fshowall%3Dtrue

这些生物学实验还提供了证据揭示了HOXA10-AS所表现出的开关样行为，并将其与患者的治疗结局相关联起来；lncRNA表达的缺失或许与低风险的大脑肿瘤发生有关，而高表达则与侵袭性脑瘤发生相关联。研究者Reimand说道，我们对本文研究结果感到非常兴奋，其不仅产生了新型的生物标志物以及关于癌症生物学研究的新观点，而且还能为我们后期持续深入研究癌症转录组学从而帮助治疗患者提供了强大的动力；如今研究人员只是开始分析RNAs在癌症中的作用，随着全转录组测序在临床上变得更加普遍且有更多的数据可用时，研究人员或许还会得到更多的有用研究结果。

对癌症基因组进行功能性注释，并识别出患者生存的新型生物标志物和调节癌症侵袭性的基因或许对于研究人员进行精准化肿瘤学研究来说非常重要，即研究人员会根据在肿瘤中所发现的遗传改变来改善癌症疗法；而深入理解驱动癌症发生和进展的关键因素或能促进研究人员识别新型治疗性靶点和疗法策略。本文研究结果或许能为研究人员带来更多癌症研究发现，从而未来有望更好地改善癌症患者的治疗。综上，本文研究结果强调了非编码转录组学在识别癌症进展的生物标志物和调节子上的泛癌症潜能。（生物谷Bioon.com）

原始出处：

Keren Isaev，Lingyan Jiang，Shuai Wu, et al. Pan-cancer analysis of non-coding transcripts reveals the prognostic onco-lncRNA HOXA10-AS in gliomas, Cell Reports (2021). DOI:10.1016/j.celrep.2021.109873