Nature Genetics：科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素
来源：科技部生物中心 2022-03-17 12:49
DNA可以决定基因表达的位置和时间，但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日，芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍
DNA可以决定基因表达的位置和时间，但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日，芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。
研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍空间的DNA序列转录活性。机器学习模型显示，转录因子（TF）通常以加法方式作用，语法较弱，大多数增强子通过一种不涉及特定TF-TF相互作用的机制来增加启动子的表达。增强子本身可分为三种类型：经典型、封闭染色质型和染色质依赖型。结果表明，很少有TF在一个细胞中具有强烈的活性，大多数活性在不同的细胞类型之间是相似的。单个TF可具有多种基因调控活性，包括染色质开放和增强，促进和决定转录起始点活性。
以上结果与“TF结合基序是基因表达的关键原子单元”的观点一致。（生物谷Bioon.com）
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