【5月29号直播预告】Nature作者等专家齐聚，从样本到CNS：时空组学全链条解决方案！

在生命科学领域，细胞与分子在时间和空间维度上的动态变化始终是探索生命奥秘的核心命题。华大时空组学凭借自主研发的Stereo-seq技术，推出两大革新性产品——时空转录组FF V1.3与时空转录组FFPE，以“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”为核心优势，为科研人员提供从样本到数据的全链条解决方案，推动生命奥秘的深度解析。5月29日14:00，华大时空组学将联合伯豪生物、生物谷，共同发起主题为“从样本到CNS，时空组学全链条解决方案 ”的空中讲坛，聚焦时空组学全链条解决方案前沿应用，相信可以为同行专家学者深入探索提供新思路。 

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嘉宾简介

李子逸 苏州系统医学研究所、研究员

李子逸，中国医学科学院/北京协和医学院系统医学研究院/苏州系统医学研究所研究员。2020年博士毕业于北京大学，2020-2025年先后在上海市免疫学研究所及澳洲加文医学研究所从事科学研究工作。李子逸博士的研究聚焦于两大核心领域：1)肿瘤相关巨噬细胞的分类与功能特性。他采用单细胞测序技术，对不同类型癌症中的肿瘤相关巨噬细胞进行了系统性地全面分析。此外，李博士还运用谱系追踪和空间转录组学技术，深入探讨了这些巨噬细胞的起源和发展以及它们在肿瘤微环境中的分布情况，揭示了其促进肿瘤免疫逃逸及支持肿瘤存活的作用机制。相关研究成果已发表于Cell (2020, 2021), Nature Cancer (2023), Science Immunology (2024)及Immunity (2024)等国际顶尖期刊。2)癌-胚重编程现象在肿瘤中的作用。李博士首次鉴定出了具有癌-胚重编程特性的肿瘤相关成纤维细胞，并证明了癌-胚重编程过程对于肝细胞癌手术后复发以及患者对联合免疫疗法响应情况的重要性(Nature Cancer, 2024)。

报告主题：“癌-胚”重编程对肝细胞癌复发和免疫治疗响应的影响

报告摘要：癌胚重编程（Onco-fetal reprogramming）是指在肿瘤发生发展过程中，肿瘤组织中出现与胚胎发育阶段相似的细胞转录特征和微环境组成。课题组通过整合胎肝与肝细胞癌的单细胞转录组数据，系统性地鉴定出三类典型的癌胚特征细胞群体：POSTN⁺成纤维细胞（CAF）、FOLR2⁺肿瘤相关巨噬细胞（TAM）和PLVAP⁺内皮细胞（EC）。细胞通讯分析与空间转录组分析进一步揭示，这三类细胞在空间上高度共定位，且存在密切的细胞间相互作用。进一步研究发现，癌胚重编程过程与上皮-间质转化（EMT）、肿瘤细胞增殖以及Treg细胞的招募密切相关，进而影响肝细胞癌患者的早期复发风险及其对免疫治疗的响应。此外，癌胚重编程系统在肝细胞癌进展过程中逐步演化，并通过“肿瘤细胞–癌胚重编程系统–Tex/Treg细胞”的作用环路，协同推动免疫抑制性微环境的构建。

宋立阳 西湖大学 博士研究生

西湖大学博士研究生，导师为杨剑教授。目前主要探索人类遗传学、统计学、深度学习与空间组学的交叉领域，致力于开发高效的统计方法和工具，希望能通过多组学数据的整合分析，为理解生物学机制和推动医学研究提供新的视角。曾在《Nature》、《Nature Computational Science》和《Trends in Genetics》等期刊以第一（共一）作者发表研究论文。

报告主题：整合空间转录组与GWAS数据绘制人复杂性性状细胞空间图谱

报告摘要：我们开发了一种名为gsMap的方法，该方法将空间转录组学（ST）数据与全基因组关联研究（GWAS）的汇总统计数据相结合，以空间分辨率将细胞映射到包括疾病在内的人类复杂性状。通过使用涵盖25个器官的胚胎ST数据集，我们通过模拟和验证各器官中已知性状相关细胞或区域，对gsMap进行了基准测试。将gsMap应用于脑部ST数据后，我们发现与精神分裂症相关的谷氨酸能神经元（glu-neurons）空间分布更接近认知性状（如智力）的分布模式，而非抑郁等情绪相关性状的分布特征。具体而言，精神分裂症相关glu-neurons集中分布于背侧海马附近区域，其钙信号传导及调控相关基因显著上调；而抑郁症相关glu-neurons则主要分布在内侧前额叶皮层深部区域，其神经可塑性与精神疾病药物靶点相关基因呈现高表达特征。gsMap为复杂疾病和性状的生物学机制提供了一个新的视角。

廖上峰 深圳华大三箭齐发科技有限责任公司 生物信息副研究员

华大生命科学研究院生物信息副研究员，毕业于清华大学。担任三箭齐发应用支持团队负责人，长期从事时空转录组工具算法开发和机器学习在脑科学与肿瘤研究中的应用，熟悉多组学数据联合分析。主导和参与了多项脑科学领域的项目研究，涉及阿尔茨海默病、帕金森病和癫痫等神经性疾病，其中一项类器官时空联用技术的研究文章已在《PNAS》发表。

报告主题：时空组学在肿瘤研究中的应用及进展

报告摘要：本讲座聚焦于时空多组学在肿瘤微环境研究中的关键作用。首先，深入探讨技术革新如何显著提升肿瘤研究的分辨率，阐述肿瘤微环境作为肿瘤研究和临床转化重要载体的意义。其次，分享时空多组学助力肿瘤微环境研究的应用实例，包括时空多组学解析肿瘤微环境中特殊空间结构，时空转录组与微生物组信息联合揭示肿瘤微环境特征，以及时空多组学赋能回顾性研究解析肿瘤进展分子机制、重构肿瘤微环境3D结构解析立体空间差异等方面。最后，介绍肿瘤3D图谱创新研究和肿瘤数字化病理大科学计划，旨在为从事肿瘤研究的科研人员提供前沿的技术思路和研究方向，推动肿瘤微环境研究，促进基础研究与临床应用的紧密结合。

董美辰 上海伯豪生物技术有限公司

毕业于上海师范大学，曾参与多项国家“863”计划项目及国家自然科学基金项目，发表论文2篇。主要负责空间转录组学以及olink蛋白组学相关技术的应用与支持工作。曾参与多项国家自然科学基金项目，具有丰富的实验端经验及多项研究的数据分析经验，擅长单组学以及多组学联合应用方向的数据挖掘与方案设计。

报告主题：空间转录组样本前处理及实验经验分享

报告摘要：本次报告将围绕空间转录组技术的样本前处理与实验操作展开，系统介绍各类样本尤其是难处理组织、FFPE等的标准化处理方案、实验流程优化及常见问题解决策略。通过实战经验分享，帮助研究者规避实验陷阱，提升数据质量，助力探索生命组织的时空分子图谱。 

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