Nature子刊: 34129例结直肠癌组织中PTEN基因突变的综合分析

2019年，估计有超过14.5万例结直肠癌(CRC)病例，超过5.1万人死亡，使其成为美国癌症发病率和死亡率的第三大常见原因，无论男女。在被诊断为患有远处疾病的患者中，5年的总存活率保持在14%，这促使人们努力通过更好地了解CRC生物学来改进治疗方案。

在过去的二十年中，人们已经认识到不同的癌亚群具有不同的病理特征和预后，对靶向治疗和放射治疗的反应也不同。临床上重要的结直肠癌鉴别特征包括肿瘤亚位；微卫星稳定(MSS)状态与高水平微卫星不稳定(MSI-H)；以及是否存在CpG岛甲基化表型(CIMP)。

抑癌基因PTEN表达或活性的丧失类似于癌基因PIK3CA的激活突变，其作用类似于提高细胞内磷脂酰肌醇(3，4，5)-三磷酸(PIP3)的水平，由AKT和其他促肿瘤信号蛋白诱导信号。

图片来源: https://doi.org/10.1038/s41467-022-29227-2

近日，费城福克斯·蔡斯癌症中心的研究者在Nature Communications杂志上发表了题为“Comprehensive characterization of PTEN mutational profile in a series of 34,129 colorectal cancers”的文章，该研究为不同的结直肠癌队列中PTEN上游和下游的蛋白的临床靶向提供了背景。

在这里，研究者分析了34,129例结直肠癌(CRC)患者的序列数据，捕获了3,434个PTEN突变。研究者确定了与微卫星稳定性/不稳定性(MSS/MSI)、肿瘤突变负荷(TMB)、患者年龄和肿瘤位置相关的PTEN突变的特定模式。

在由MSS/MSI状态分隔的组内，这确定了核苷酸热点的不同图谱，并暗示了突变对蛋白质破坏影响的不同图谱。此外，PTEN突变的离散类别与其他在CRC发病机制中重要的基因的突变模式不同，包括KRAS、APC、TP53和PIK3CA。

影响PTEN蛋白的突变热点

图片来源: https://doi.org/10.1038/s41467-022-29227-2

在这项研究中，研究者分析了基础医学公司(FMI)描述的34,129例结直肠癌患者的PTEN突变模式。这项分析捕获了在肿瘤中发现的3434个体细胞PTEN变化的数据，使我们能够指定特定的突变模式，作为肿瘤亚点、年龄、性别、MSI-H/MSS状态、肿瘤突变负担(TMB)以及与其他驱动突变的共同分离的结果。

这些数据还确定了以前未报道的PTEN热点，以及影响PTEN脂磷酸酶活性和稳定性的突变模式，这些模式区分了离散的患者队列。（生物谷 Bioon.com）

参考文献

Ilya G. Serebriiskii et al. Comprehensive characterization of PTEN mutational profile in a series of 34,129 colorectal cancers. Nat Commun. 2022 Mar 25;13(1):1618. doi: 10.1038/s41467-022-29227-2.