Biomedicines:羊水细胞外囊泡中的lncRNA,有望成为产前肾积水诊断新“利器”
来源:生物谷原创 2025-04-09 20:40
本研究从羊水小细胞外囊泡中鉴定出6种差异表达的已知lncRNAs,其中3种高表达的在更多样本中得到验证,还预测了4种高表达的新lncRNAs,其或可作为产前肾积水有前景的诊断生物标志物。
在孕期产检中,不少准妈妈可能会遇到这样的情况:超声检查提示胎儿存在肾积水。这就是产前肾积水(ANH),它是常见的先天性肾和泌尿道异常。据统计,病理肾积水在新生儿中的发生率为0.3-0.6%,大约15-20%的ANH患儿需要手术治疗,尤其是双肾梗阻时,肾功能会快速恶化。当前,产前超声和磁共振成像虽能检测ANH,但超声参数预测准确性欠佳,且缺乏有效的生物标志物辅助诊断。
近日,发表于Biomedicines的一项研究Development of LncRNA Biomarkers in Extracellular Vesicle of Amniotic Fluid Associated with Antenatal Hydronephrosis为ANH的诊断带来了新的思路。该研究聚焦于羊水小细胞外囊泡(sEVs)中的长链非编码RNA(lncRNA),试图寻找潜在的ANH诊断生物标志物。
研究团队从湘雅医院妇产科招募了10名患有III-IV级ANH的孕妇和10名正常孕妇。对获取的羊水样本进行处理,提取sEVs并对其进行一系列表征分析,之后对sEVs中的RNA进行测序,分析mRNA和lncRNA的表达情况,还预测了新的lncRNA及其靶基因。
图 1:羊水来源的sEVs RNA测序分析及其特征
研究结果令人眼前一亮。通过透射电镜(TEM)、纳米颗粒跟踪分析(NTA)和蛋白质免疫印迹(WB)等技术,证实了成功提取的sEVs具有完整的膜结构和典型特征。mRNA测序分析发现,ANH组和对照组之间有836个差异表达的mRNA(DE-mRNA),这些基因主要参与囊泡、细胞内和细胞质功能,在营养物质消化吸收等通路显著富集,并且与肾脏系统发育相关的关键转录因子表达上调。
在已知的lncRNA分析中,研究人员鉴定出6个差异表达的lncRNA(DE-lncRNA),其中5个上调,1个下调。对4个上调的lncRNA进行qRT-PCR验证,结果显示其中3个在ANH患者羊水来源的sEVs中表达显著上调。以ENST00000454380(LINC02863)为例,它与肾脏发育关键基因PAX8相互作用,KEGG富集分析表明其涉及细胞间信号传导等重要过程,这暗示它在ANH发生发展中可能起着关键作用。
图 2:ANH组和对照组中已知的DE-lncRNAs及其相应靶基因的表达和网络分析
此外,研究还预测了17355个新的lncRNA,并发现4个在ANH中显著上调的新DE-lncRNA。它们的靶基因参与间充质形态发生、STAT3信号通路等,这些通路与肾脏发育和纤维化密切相关,表明这些新lncRNA可能是ANH潜在的生物标志物和治疗靶点。
图 3:选定的已知DE-lncRNAs的表达分析和验证
总的来说,这项研究首次揭示了ANH羊水来源sEVs的RNA转录组特征,发现DE-mRNA和DE-lncRNA均与胎儿肾脏发育异常有关。验证的已知DE-lncRNA有望成为ANH诊断的生物标志物,新发现的lncRNA也为进一步研究ANH的发病机制和治疗提供了方向。未来,随着研究的深入,这些发现或许能转化为临床应用,帮助医生更准确地诊断和治疗ANH,为准妈妈们和宝宝的健康保驾护航。(生物谷Bioon.com)
参考文献:
Fu Y, Liu Q, Yao R, et al. Development of LncRNA Biomarkers in Extracellular Vesicle of Amniotic Fluid Associated with Antenatal Hydronephrosis. Biomedicines. 2025;13(3):668. Published 2025 Mar 8. doi:10.3390/biomedicines13030668
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