中国科学家揭示新冠肺炎在武汉的早期传播动态
来源:小柯生命 2020-02-03 09:48
2020年1月29日,中国疾病预防控制中心冯子健、香港大学Gabriel M. Leung和Benjamin J. Cowling、湖北省疾病预防控制中心杨波联合在国际顶级期刊《新英格兰医学杂志》上发表了题为“新型冠状病毒感染性肺炎在武汉的早期传播动态”的文章。新型冠状病毒(2019-nCoV)感染肺炎(NCIP)初始病例于2019年12月和2020年1月在
2020年1月29日,中国疾病预防控制中心冯子健、香港大学Gabriel M. Leung和Benjamin J. Cowling、湖北省疾病预防控制中心杨波联合在国际顶级期刊《新英格兰医学杂志》上发表了题为“新型冠状病毒感染性肺炎在武汉的早期传播动态”的文章。
新型冠状病毒(2019-nCoV)感染肺炎(NCIP)初始病例于2019年12月和2020年1月在中国湖北省武汉市发生。
最早的病例是通过“病因不明的肺炎”监测机制确定的。
病因不明的肺炎定义为一种无病因的疾病,根据指南符合以下标准:发烧(≥38°C),有肺炎影像学证据,白细胞计数降低或正常或淋巴细胞计数降低,抗菌治疗3至5天后症状无改善。
由中国疾控中心和当地疾控中心的工作人员组成的联合小组,对所有疑似和确诊的2019-nCoV病例进行了详细的实地调查。
研究组分析了武汉市425例确诊病例的资料,以确定NCIP的流行病学特征。
研究组收集了截至2020年1月22日已报告的实验室确诊NCIP病例的人口学特征、暴露史和疾病时间表的信息,描述这些病例的特点,估计主要的流行病学延时分布。
研究组将一个带有人畜共患传染病的传播模型拟合到与华南海鲜批发市场无关的发病日期,并利用该模型推导出流行病增长率、流行病倍增时间和基本繁殖数(R0),即在其他未感染人群中,一个病例在其感染期内平均会产生的额外病例。
他们在SARS序列的基础上对2019-nCoV序列进行了信息先验分布,平均值为8.4,标准差为3.8.
疫情发展呈指数增长,最近几天的下降很可能是因近期病例确诊不足,以及鉴定和报告延迟所致,而非疫情的真正转折点。
具体地说,曲线的后一部分并不表示病例数量减少,而是由于在截止日期确诊延迟。
随着时间的推移,病毒检测盒的可用性和使用量均有所增加,在解读1月份病例增长速度时应格外谨慎。
武汉市首批425例新型冠状病毒感染性肺炎(NCIP)确诊病例发病情况分析
最早的病例大多接触了华南海鲜批发市场,但从12月下旬开始,无关联病例呈指数增长。
在前425名确诊为NCIP的患者中,中位年龄为59岁(15-89岁),56%为男性。未发现15岁以下儿童的病例。
研究组分三个时间段检测病例特征:
第一个时间段为1月1日前发病的患者,即华南海鲜批发市场关闭之日;
第二个时间段为1月1日至11日发病的患者,即向武汉提供RT-PCR试剂盒之日;
第三个时间段为1月12日及之后发病的患者。
发病较早的患者年龄稍小,男性发病的可能性较大,且大概率与华南海鲜批发市场有关。在这三个时期,医护工作者患病比例逐渐增加。
武汉市2020年1月22日新型冠状病毒感染肺炎患者特征分析
2020年1月1日前发病的大多数病例(55%)与华南海鲜批发市场有关,而随后的病例中仅有8.6%。
研究组检查了10个确诊病例的暴露数据,估计平均潜伏期为5.2天,分布的95%为12.5天。
研究组还获得了5组案例的信息,根据6对病例的发病日期,他们估计序列区间分布的平均值为7.5±3.4天。
在2020年1月4日的流行曲线中,流行增长率为0.10/天,倍增时间为7.4天。利用上述序列区间分布,研究组估计R0为2.2。
据估计,1月1日前发病的45名患者从发病到首次就诊的时间平均为5.8天,与1月1日至11日发病的207名患者的时间相似,平均为4.6天。
1月1日前发病的44例患者从发病到入院的平均持续时间估计为12.5天,比1月1日至11日发病的189例患者长(平均9.1天)。
尚无1月12日及之后发病的患者分布图,因为那些近期发病且发病持续时间较长的患者尚未被发现。
关键时间-事件分布
五组(16例)患者中暴露和发病日期的详细信息
总之,研究组发现,在研究阶段,NCIP病例在武汉大约每7.4天增加一倍。
从12月中旬开始,密切接触者之间的人际传播开始出现,并在此后一个月内逐渐扩散。
如果其他地方也出现类似的情况,则需要做出相当大的努力来减少传播,以控制疫情。
应继续监测病例特征,以查明流行病学方面的任何变化,并制定措施来预防或减少高危人群中的传播。(生物谷 Bioon.com)
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