研究揭示犬传染性生殖器肿瘤染色体不稳定区域及癌症易感性

犬传染性生殖器肿瘤（Canine transmissible venereal tumors，CTVT）是目前全世界范围内仅有的3种哺乳动物传染性肿瘤之一，也是最古老的肿瘤细胞系。前期，中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平团队与古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹团队发现，作为肿瘤“活化石”的CTVT记录了从郊狼到北美土著家犬的古老渐渗，这提示了该肿瘤基因组的复杂性。虽然早期罹患肿瘤动物（CTVT founder）的体细胞突变已被解析，但鲜有关于肿瘤基因组本身遗传变异特征的研究。

为了进一步确认CTVT基因组遗传变异对肿瘤进展的影响，并探究其对人类肿瘤学研究是否具有借鉴意义，张亚平团队与昆明动物所研究员王国栋团队合作，利用44个国家543个CTVT全基因组或外显子组公共数据，确认了中国南方CTVT属于早期肿瘤谱系，且可能从俄罗斯-乌克兰地区传入。进一步，根据全球CTVT系统发育关系，该研究分析出CTVT的早期结构变异（structural variation，SVs）事件，并结合三代转录组测序数据，进而证实了由此产生的11个胚系基因融合（germline gene fusions，GGFs），且其中包含1个复杂基因融合“Greedy Fusion”——HSD17B4-DMXL1-TNFAIP8。研究通过与33种人类肿瘤跨物种比较发现，这些GGFs显示出更高的遗传易感性，并在肿瘤退化期显示出下调特征，与DNA甲基化水平有关，突出了CTVT作为肿瘤模型的研究价值。

近日，相关研究成果以Germline gene fusions across species reveal the chromosomal instability regions and cancer susceptibility为题，在线发表在iScience上。研究工作得到国家重点研发计划、科技创新2030-重大专项“脑科学与类脑研究”项目、昆明市“春城计划”、云南省基础研究计划、国家自然科学基金和中国科学院青年创新促进会等的支持，并获得四川大学华西医院和公安部昆明警犬基地等的协助。