科学家绘制首份全面健康乳腺细胞图谱！Nat Med：正常乳腺细胞的全面完整蓝图，有望帮助揭示人类乳腺癌的起源

单核分析技术能够实现强大的细胞类型分类，并帮助建立染色质可及性与特定细胞类型的基因表达之间的联系。

近日，一篇发表在国际杂志Nature Medicine上题为“Single-nucleus chromatin accessibility and transcriptomic map of breast tissues of women of diverse genetic ancestry”的研究报告中，来自印第安纳大学医学院等机构的科学家们绘制了迄今为止最为全面的健康乳腺细胞图谱，有望成为理解乳腺癌发病机制及其在不同遗传背景人群中差异的重要工具。

在这项研究中，科学家们利用来自不同遗传背景女性的健康乳腺组织，构建了一个综合的乳腺组织细胞图谱。图谱详细记录了各种细胞类型如何组织其基因组，以及这种组织方式如何影响细胞内RNA的产生，进而驱动乳腺各部位的功能表现。Harikrishna Nakshatri博士指出，乳腺癌患者的治疗效果与遗传背景有关，虽然社会经济因素是一个重要因素，但生物学特征和遗传背景同样发挥着重要作用。

科学家成功绘制出正常乳腺细胞的全面完整蓝图 有望帮助揭示人类乳腺癌的起源

图片来源：Nature Medicine (2024). DOI:10.1038/s41591-024-03011-9

为了更好地理解这些问题，研究团队对92位女性的88,000个细胞核进行了测序分析。这些捐赠者来自非洲、欧洲、美洲原住民、拉丁美洲、东亚以及德系犹太人和欧洲人群体，她们向IU Simon综合癌症中心的Komen组织样本库捐赠了健康乳腺组织。

研究者表示，细胞图谱不仅包括多种细胞类型中所表达的基因数据，还揭示了基因的组织方式以及哪些基因表达是特定于某一细胞类型的。由于乳腺癌通常起源于特定的细胞类型，其起源会导致不同的癌细胞类型和疗法反应。因此，这项研究有助于加深我们对乳腺癌发病机制的理解，并可能发现新的治疗靶点。

Nakshatri博士强调，研究的目标是了解正常乳腺组织的基本构成，即正常乳腺组织中存在多少种不同的细胞类型，以及这些细胞的基本成分如何表现出依赖遗传背景的变异性。只有明确了乳腺癌起源于哪些细胞类型，才能真正理解乳腺癌相对于正常乳腺组织发生了什么变化。

以往的研究资源主要依赖于乳腺癌手术后剩余的正常组织和乳房整形手术中的样本。而Komen组织样本库是全球唯一一个专门收集健康乳腺组织的样本库，为这项研究提供了独特且宝贵的资料来源。研究人员使用的均是来自未患乳腺癌女性的组织样本，因此认为这些数据非常接近真实情况，也是目前可以获得的最佳数据。

这项研究的数据将被永久保存，并可供多个研究团队在未来的研究中使用。此外，这项研究中的细胞图谱信息将通过美国国立卫生研究院、人类细胞图谱计划以及陈-扎克伯格细胞项目（Chan Zuckerberg CELL）提供的数据库向乳腺癌研究者开放。

综上，本研究的成果为深入研究人类健康乳腺生物学中遗传背景依赖性的变异性提供了宝贵的研究资源。（生物谷Bioon.com）

参考文献：

Poornima Bhat-Nakshatri, Hongyu Gao, Aditi S. Khatpe, et al. Single-nucleus chromatin accessibility and transcriptomic map of breast tissues of women of diverse genetic ancestry, Nature Medicine (2024). DOI:10.1038/s41591-024-03011-9