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Nat Commun:科学家开发出了一种鉴别恶性肿瘤的新型诊断技术

来源:本站原创 2019-11-04 22:12

2019年11月4日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过研究开发了一种新型廉价的方法来识别趋于恶性的高度异质性肿瘤,这类肿瘤或许需要进行积极性地治疗和应对。

图片来源:CC0 Public Domain

癌细胞的常见特性就是染色体或基因组中基因拷贝数的改变(CNAs,copy number alterations),在相同肿瘤中,属于肿瘤不同构造部位的细胞携带着不同的CNAs,携带较多CNAs的肿瘤往往更具侵袭性,即使患者进行了严格的治疗,这类肿瘤也会死灰复燃。这项研究中,研究人员开发了一种名为CUTseq的新型基因组手段,其能以比现有技术更低的成本对相同肿瘤不同部位中的CNAs的水平和类型进行评估分析。

研究者Nicola Crosetto表示,我希望CUTseq技术能帮助寻找到癌症诊断领域更多有用的方向或思路,目前多区域的肿瘤测序将会越来越多地应用于癌症诊断上,从而识别出携带高度异质性肿瘤的患者,进而便于患者及时就诊治疗,本文中研究者所开发的新技术或能有效用于这一目的。

该技术能对多个活组织中提取的DNA进行分析,甚至对组织切片中的微量成分进行分析,通过利用特殊的分子条形码对相同肿瘤样本的不同区域所提取的DNA进行标记,研究者就能在单一的测序实验中对肿瘤CNAs的异质性进行全方位的分析和图谱绘制;CUTseq技术的应用不仅限于癌症诊断;比如,CUTseq技术还能用作细胞系鉴别的平台,同时还能监测大型细胞系储存库和生物银行中基因组的稳定性。

最后研究者表示,如果该技术能应用于生态学研究领域,其或能代替其它基因组测序方法,比如RAD-seq,以较低的成本对生物多样性进行有效评估。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Xiaolu Zhang, Silvano Garnerone, Michele Simonetti, et al. CUTseq is a versatile method for preparing multiplexed DNA sequencing libraries from low-input samples, Nature Communications (2019). DOI:10.1038/s41467-019-12570-2

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