Nature:利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成
来源:本站原创 2019-07-28 08:29
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤(medulloblastoma)是一种恶性儿童小脑肿瘤类型,包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型:WNT和SHH(均由它们的同名基因发生的突变驱动),组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60%,但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外,尽管这些亚型的基因组
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤(medulloblastoma)是一种恶性儿童小脑肿瘤类型,包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型:WNT和SHH(均由它们的同名基因发生的突变驱动),组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60%,但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。
此外,尽管这些亚型的基因组特征已得到明确定义,但是细胞多样性在多大程度上构成了它们不同的生物学和临床行为的基础,在很大程度上仍未被探索。
在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院、麻省总医院、哈佛医学院和布罗德研究所等研究机构的研究人员利用单细胞转录组学研究了囊括成神经管细胞瘤所有4种分子亚型的25种成神经管细胞瘤样本中的肿瘤内异质性和肿瘤间异质性。相关研究结果于2019年7月24日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics”。
这些研究人员发现WNT亚型、SHH亚型和组3亚型包含亚型特异性的未分化神经元样恶性肿瘤细胞群体和分化神经元样恶性肿瘤细胞群体,然而,组4亚型仅由分化的神经元样肿瘤细胞组成。
SHH亚型非常类似于处于与患者年龄相关的不同分化状态的颗粒神经元。组3和组4亚型显示出从原始祖细胞样细胞(progenitor-like cell)到更成熟的神经元样细胞(neuronal-like cell)的发育轨迹,而且这两种细胞类型的相对比例可区分这两种亚型。
跨物种转录组学分析将不同的谷氨酸能神经元群体定义为SHH亚型和组4亚型的推定细胞来源。
总之,这些数据对亚型特异性的成神经管细胞瘤生物学的细胞状态和发育状态提供了新的见解。(生物谷 Bioon.com)
参考资料:
Volker Hovestadt et al. Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1434-6.
此外,尽管这些亚型的基因组特征已得到明确定义,但是细胞多样性在多大程度上构成了它们不同的生物学和临床行为的基础,在很大程度上仍未被探索。
在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院、麻省总医院、哈佛医学院和布罗德研究所等研究机构的研究人员利用单细胞转录组学研究了囊括成神经管细胞瘤所有4种分子亚型的25种成神经管细胞瘤样本中的肿瘤内异质性和肿瘤间异质性。相关研究结果于2019年7月24日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics”。
图片来自Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1434-6。
这些研究人员发现WNT亚型、SHH亚型和组3亚型包含亚型特异性的未分化神经元样恶性肿瘤细胞群体和分化神经元样恶性肿瘤细胞群体,然而,组4亚型仅由分化的神经元样肿瘤细胞组成。
SHH亚型非常类似于处于与患者年龄相关的不同分化状态的颗粒神经元。组3和组4亚型显示出从原始祖细胞样细胞(progenitor-like cell)到更成熟的神经元样细胞(neuronal-like cell)的发育轨迹,而且这两种细胞类型的相对比例可区分这两种亚型。
跨物种转录组学分析将不同的谷氨酸能神经元群体定义为SHH亚型和组4亚型的推定细胞来源。
总之,这些数据对亚型特异性的成神经管细胞瘤生物学的细胞状态和发育状态提供了新的见解。(生物谷 Bioon.com)
参考资料:
Volker Hovestadt et al. Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1434-6.
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